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单细胞拷贝数变异分析

单细胞拷贝数变异(scCNV)分析旨在检测单个细胞内基因组片段的获得和丢失,使研究人员能够以单细胞分辨率解析肿瘤内异质性、重建克隆演化并区分恶性细胞与正常细胞。该方法可直接应用于单细胞全基因组测序数据,或从scRNA-seq或scATAC-seq实验的读数深度信号中推断得出。

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来源

  1. Garvin, T., Aboukhalil, R., Kendall, J., Baslan, T., Atwal, G. S., Hicks, J., Wigler, M., & Schatz, M. C. (2015). Interactive analysis and assessment of single-cell copy-number variations. Nature Methods, 12(11), 1058–1060. link
  2. Gao, R., Bai, S., Henderson, Y. C., Lin, Y., Schalck, A., Yan, Y., Kumar, T., Hu, M., Sei, E., Davis, A., Wang, F., Shaitelman, S. F., Wang, J. R., Chen, K., Moulder, S., Lai, S. Y., & Navin, N. E. (2021). Delineating copy number and clonal substructure in human tumors from single-cell transcriptomes. Nature Biotechnology, 39(5), 599–608. link

如何引用本页

ScholarGate. (2026, June 3). Single-cell Copy Number Variation Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/zh/bioinformatics/single-cell-copy-number-variation-analysis

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被引用于

ScholarGateSingle-cell Copy Number Variation Analysis (Single-cell Copy Number Variation Analysis). 于 2026-06-15 检索自 https://scholargate.app/zh/bioinformatics/single-cell-copy-number-variation-analysis · 数据集: https://doi.org/10.5281/zenodo.20539026