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基于网络的通路富集分析
基于网络的通路富集分析将分子相互作用网络——蛋白质-蛋白质相互作用、信号传导图谱或基因调控网络——与组学测量相结合，以识别在特定条件下发生协调改变的生物通路。与将通路基因视为独立列表的经典过表达或基因集富集方法不同，这类方法将信号跨网络边缘传播，捕捉相互作用的拓扑结构，并揭示平面列表富集会遗漏的失调模块。
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来源
- Ideker, T., Ozier, O., Schwikowski, B., & Siegel, A. F. (2002). Discovering regulatory and signalling circuits in molecular interaction networks. Bioinformatics, 18(suppl_1), S233–S240. link ↗
- Vaske, C. J., Benz, S. C., Sanborn, J. Z., Earl, D., Szeto, C., Zhu, J., Haussler, D., & Stuart, J. M. (2010). Inference of patient-specific pathway activities from multi-dimensional cancer genomics data using PARADIGM. Bioinformatics, 26(12), i237–i245. DOI: 10.1093/bioinformatics/btq182 ↗
如何引用本页
ScholarGate. (2026, June 3). Network-based Pathway Enrichment Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/zh/bioinformatics/network-based-pathway-enrichment-analysis
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- 基因集富集分析 (GSEA)生物信息学↔ 比较