Аналіз ATAC-seq
ATAC-seq (Assay for Transposase-Accessible Chromatin using sequencing) — це метод для профілювання ландшафту доступності хроматину в масштабі всього геному. Розроблений Buenrostro та співавторами у 2013 році, ATAC-seq використовує гіперактивну транспозазу для позначення відкритих, доступних ділянок хроматину, що дозволяє швидко та чутливо ідентифікувати регуляторні елементи ДНК. ATAC-seq став стандартним методом для характеристики регуляторних ландшафтів генів, виявлення регуляторних елементів, специфічних для певного типу клітин, та виведення регуляторних мереж генів.
Читати метод повністю
Увійдіть із безкоштовним обліковим записом, щоб прочитати цей розділ.
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
Джерела
- Buenrostro, J. D., Giresi, P. G., Zaba, L. C., Chang, H. Y., & Greenleaf, W. J. (2013). Transposition of native chromatin for fast and sensitive epigenomic profiling of cell populations and tissues. Nature Methods, 10(12), 1213–1218. link ↗
- Corces, M. R., Buenrostro, J. D., Wu, B., Greenside, P. G., Chan, S. M., Koenig, J. L., & Greenleaf, W. J. (2017). Lineage-specific and single-cell chromatin accessibility charts human hematopoiesis. Nature Genetics, 48(10), 1193–1203. DOI: 10.1038/ng.3646 ↗
- Satpathy, A. T., Granja, J. M., Yost, K. E., Qi, Y., Meschi, F., McDermott, G. P., & Chang, H. Y. (2019). Massively parallel single-cell chromatin landscapes. Nature Biotechnology, 37(12), 1452–1462. link ↗
Як цитувати цю сторінку
ScholarGate. (2026, June 3). ATAC-seq Analysis for Chromatin Accessibility and Regulatory Landscapes. ScholarGate. https://scholargate.app/uk/genetics/atac-seq-analysis
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
- Аналіз Hi-CГенетика↔ compare
- РНК-швидкістьГенетика↔ compare
Згадується в
Помітили помилку на цій сторінці? Повідомте про неї або запропонуйте виправлення →