Аналіз Hi-C
Hi-C (High-Chromosome Conformation Capture) — це техніка та пов'язані з нею обчислювальні методи для картографування 3D-архітектури геному в клітинах. Розроблений Ліберманом-Айденом і Деккером у 2009 році, Hi-C ідентифікує фізичні взаємодії між геномними регіонами, які можуть бути віддаленими за лінійною послідовністю, але просторово близькими в 3D-ядерному просторі. Аналіз Hi-C виявив фундаментальні принципи організації геному, включаючи існування топологічно асоційованих доменів (TAD), і надає уявлення про те, як 3D-структура регулює експресію генів і реплікацію ДНК.
Читати метод повністю
Увійдіть із безкоштовним обліковим записом, щоб прочитати цей розділ.
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
Джерела
- Lieberman-Aiden, E., van Berkum, N. L., Williams, L., Imakaev, M., Ragoczy, T., Telling, A., & Dekker, J. (2009). Comprehensive mapping of long-range interactions reveals folding principles of the human genome. Science, 326(5950), 289–293. DOI: 10.1126/science.1181369 ↗
- Dixon, J. R., Selvaraj, S., Yue, F., Kim, A., Li, Y., Shen, Y., & Ren, B. (2012). Topological domains in mammalian genomes identified by analysis of chromatin interactions. Nature, 485(7398), 376–380. DOI: 10.1038/nature11082 ↗
- Szabo, Q., Bantignies, F., & Cavalli, G. (2019). 3D chromatin architecture. Nature Reviews Molecular Cell Biology, 20(4), 207–220. link ↗
Як цитувати цю сторінку
ScholarGate. (2026, June 3). Hi-C Analysis of 3D Genome Organization and Chromatin Interactions. ScholarGate. https://scholargate.app/uk/genetics/hi-c-analysis
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
- Аналіз ATAC-seqГенетика↔ compare
- РНК-швидкістьГенетика↔ compare
Згадується в
Помітили помилку на цій сторінці? Повідомте про неї або запропонуйте виправлення →