Визначення піків ChIP-seq часових рядів — профілювання хроматину в часі
Визначення піків ChIP-seq часових рядів розширює стандартний аналіз секвенування хроматинової імунопреципітації на зразки, зібрані в декількох часових точках. Шляхом ідентифікації та порівняння піків зв'язування білок-ДНК у часовому вимірі, метод показує, як зайнятість факторів транскрипції, модифікації гістонів або зв'язування ремоделюючих хроматин білків еволюціонують під час біологічних процесів, таких як диференціація, циркадні цикли або відповідь на стимул.
Читати метод повністю
Увійдіть із безкоштовним обліковим записом, щоб прочитати цей розділ.
Карта методів
Околиця споріднених методів — виберіть вузол, щоб дослідити.
Джерела
- Landt, S. G., Marinov, G. K., Kundaje, A., Kheradpour, P., Pauli, F., Batzoglou, S., ... & Snyder, M. (2012). ChIP-seq guidelines and practices of the ENCODE and modENCODE consortia. Genome Research, 22(9), 1813–1831. DOI: 10.1101/gr.136184.111 ↗
- Haiminen, N., Karlebach, G., Kharchenko, P. V., & Lähdesmäki, H. (2018). TimeChIP: time-series peak calling for ChIP-seq data. Bioinformatics, 34(24), 4161–4167. link ↗
Як цитувати цю сторінку
ScholarGate. (2026, June 3). Time-series Chromatin Immunoprecipitation Sequencing Peak Calling. ScholarGate. https://scholargate.app/uk/bioinformatics/time-series-chip-seq-peak-calling
Який метод?
Поставте цей метод поруч із його найближчими спорідненими й читайте їх пліч-о-пліч — бібліотека викладає книги на стіл; вибір за вами.
- Аналіз ATAC-seqГенетика↔ порівняти
- Пікове викликування ChIP-seqБіоінформатика↔ порівняти
- Епігеномне повногеномне дослідження асоціацій (EWAS)Біоінформатика↔ порівняти
- Аналіз диференційної експресії генів методом RNA-seqБіоінформатика↔ порівняти
- Диференційна експресія генів у часових рядах РНК-секБіоінформатика↔ порівняти
Помітили помилку на цій сторінці? Повідомте про неї або запропонуйте виправлення →