Seri Aralık ve Jenerasyon Süresi
Jenerasyon süresi, birincil vakanın enfeksiyonu ile neden olduğu ikincil vakaların enfeksiyonu arasındaki süreyi ifade ederken; seri aralık, birincil vakada semptom başlangıcı ile ikincil vakalarda semptom başlangıcı arasındaki süredir. Enfeksiyon zamanları genellikle gözlemlenemediğinden, seri aralık sürveyansın ölçebildiği ve jenerasyon süresi için pratik bir vekil (proxy) olarak kullanılan bir niceliktir; her iki nicelik de bulaşmanın zamanlamasını, bir hastalığın ne kadar hızlı yayıldığının tahminiyle ilişkilendirmektedir.
Tanım
Jenerasyon süresi, bir vakanın enfeksiyonu ile enfekte ettiği kişilerin enfeksiyonu arasındaki süredir; seri aralık ise bir vakada semptom başlangıcı ile enfekte ettiği kişilerde semptom başlangıcı arasındaki süredir ve jenerasyon süresi için gözlemlenebilir bir vekil olarak kullanılmaktadır.
Kapsam
Bu madde, jenerasyon süresini seri aralıktan ayırmakta, her birinin inkübasyon ve enfeksiyöz (bulaşıcı) dönemlerle nasıl ilişkili olduğunu açıklamakta ve bu zamanlama ölçütlerinin epidemik büyüme hızını üreme sayısına nasıl bağladığını tanımlamaktadır. Bu, metodolojik bir referans konu olup, klinik bir rehberlik niteliği taşımamaktadır.
Temel sorular
- Jenerasyon süresi ve seri aralık nasıl farklılık gösterir ve bu ayrım neden önemlidir?
- Bu aralıklar inkübasyon dönemi ve enfeksiyöz dönemle nasıl ilişkilidir?
- Seri aralık dağılımı, üreme sayısını tahmin etmek için nasıl kullanılmaktadır?
- Jenerasyon süresi neden genellikle doğrudan gözlemlenmek yerine tahmin edilmektedir?
Anahtar kavramlar
- Jenerasyon süresi (jenerasyon aralığı)
- Seri aralık
- İnkübasyon dönemi
- Latent ve enfeksiyöz (bulaşıcı) dönemler
- Seri aralık dağılımı
- Epidemik büyüme hızı
- Zamanlamadan üreme sayısının tahmini
Temel kuramlar
- Jenerasyon aralığı ve büyüme hızı-R ilişkisi
- Wallinga ve Lipsitch, jenerasyon aralığı dağılımının şeklinin, gözlemlenen bir epidemik büyüme hızının üreme sayısına nasıl dönüştüğünü belirlediğini göstermiştir; bu nedenle zamanlama ölçütleri bulaşıcılığı yorumlamak için esastır.
Mekanizmalar
Bulaşma zamanlaması, enfeksiyonun doğal seyrinden kaynaklanmaktadır: enfeksiyondan sonra, bir konağın bulaşıcı hale gelmesinden önce bir latent dönem ve semptomlar ortaya çıkmadan önce bir inkübasyon dönemi bulunmaktadır; konak, enfeksiyöz (bulaşıcı) dönemi boyunca bulaştırmaktadır. Jenerasyon süresi enfeksiyondan enfeksiyona ölçüm yaparken, seri aralık başlangıçtan başlangıca ölçüm yapmaktadır; ikisi bazı varsayımlar altında ortalama olarak çakışsa da varyans açısından farklılık göstermektedir. Enfeksiyon zamanları nadiren gözlemlendiğinden, analistler, seri aralık dağılımını epidemik büyüme hızıyla birlikte üreme sayısını tahmin etmek için kullanmaktadır; bu, kimin kimi enfekte ettiğine dair olasılıkları veya vaka başlangıç verilerinden zamana bağlı üreme sayılarını elde eden yöntemleri de içermektedir.
Klinik önem
Zamanlama ölçütleri, analistlerin gözlemlenen vaka eğrilerini bulaşıcılık tahminlerine dönüştürmesine ve bir salgının ne kadar hızlı büyüdüğünü değerlendirmesine olanak tanımaktadır. Bunlar, bulaşma sürecini ve epidemiyolojik tahminlerin oluşturulmasını tanımlayan referans nicelikler olup, bireysel tanı veya tedavi kararları için bir temel değildir.
Epidemiyoloji
Tahmini seri aralıklar ve jenerasyon süreleri patojene göre değişmekte ve enfeksiyöz dönemi kısaltan kontrol önlemlerinden etkilenmektedir. Solunum yolu virüsleri için inkübasyon dönemlerine ilişkin derlemeler, doğal seyrin zamanlamasının ajanlar arasında nasıl farklılık gösterdiğini göstermektedir ve SARS analizleri, bulaşıcılığı tahmin etmek için başlangıç verilerini kullanmıştır. Bu nedenle bildirilen aralıklar patojene ve ortama özgüdür.
Tarihçe
Ardışık vakalar arasındaki aralık fikri epidemiyolojide köklü bir geçmişe sahiptir ve Fine'ın seri aralığı altta yatan bulaşma zamanlamasından ayıran açıklamasıyla netleştirilmiştir. 2000'li yıllarda Wallinga ve meslektaşlarının çalışmaları, jenerasyon aralığının büyüme hızlarını üreme sayılarına bağlamadaki rolünü resmileştirmiş ve başlangıç verilerini kullanarak pratik tahmin yöntemleri geliştirmiştir; bu çalışmalar daha sonra zamana bağlı üreme sayıları için yazılım tabanlı çerçevelerle desteklenmiştir.
Tartışmalar
- Seri aralık, jenerasyon süresi yerine güvenle kullanılabilir mi?
- Seri aralık gözlemlenebilir olmakla birlikte, varyans açısından jenerasyon aralığından farklılık gösterebilmekte ve hatta semptom öncesi bulaşma meydana geldiğinde negatif bile olabilmektedir; bu nedenle, aradaki fark dikkate alınmadığı sürece, onu bir vekil olarak kullanmak üreme sayısı tahminlerini yanıltabilmektedir.
Öne çıkan isimler
- Jacco Wallinga
- Marc Lipsitch
- Paul Fine
- Anne Cori
- Justin Lessler
İlgili konular
Temel eserler
- wallinga-lipsitch-2007
- wallinga-teunis-2004
- fine-2003
Sıkça sorulan sorular
- Seri aralık ile jenerasyon süresi arasındaki fark nedir?
- Jenerasyon süresi enfeksiyon olayları arasında ölçülürken, seri aralık semptom başlangıç zamanları arasında ölçülmektedir; seri aralık gözlemlenebilir olup, enfeksiyon zamanları genellikle bilinmediği için bir vekil olarak kullanılmaktadır.
- Bu aralıklar neden üreme sayısını tahmin etmek için kullanılmaktadır?
- Ardışık enfeksiyonlar arasındaki zamanlama dağılımı, gözlemlenen epidemik büyüme hızını vaka başına düşen ikincil vaka sayısına bağlamaktadır; bu nedenle vakaların ne kadar hızlı arttığını bir üreme sayısına dönüştürmek için gereklidir.