Başlıca Viral Aileler ve İnsan Patojenleri
Bu alan, insanları enfekte eden başlıca virüs ailelerini, genomlarının moleküler yapısına ve replikasyon stratejilerine göre düzenleyerek incelemektedir. Viroloji uzmanlarının patojenleri nasıl sınıflandırdığına dair yol gösterici bir harita sunmakta ve bu sınıflandırmayı, herpesvirüs latensinden ve grip pandemilerinden retroviral entegrasyona ve ortaya çıkan zoonozlara kadar, her grubun neden olduğu başlıca insan hastalıklarıyla ilişkilendirmektedir.
Tanım
Başlıca viral aileler ve insan patojenleri, tıbbi öneme sahip, taksonomik olarak tanımlanmış virüs gruplarını ifade etmektedir; bunlar genom tipine ve replikasyon stratejisine (Baltimore sınıflandırma şeması) göre ve insan konakçılarındaki ortak yapısal ve hastalık özelliklerine göre gruplandırılmaktadır.
Kapsam
Bu madde, tıbbi açıdan önemli virüs ailelerini bir sınıflandırma şeması (classification scheme) içinde ele almakta ve her geniş grubu kendine özgü biyolojisi ve hastalık ilişkileriyle bağlantılandırmaktadır. Altında yer alan konu düğümlerini tanıtan bir referans genel bakış niteliğindedir: DNA virüsleri, pozitif polariteli RNA virüsleri ve koronavirüsler, negatif polariteli RNA virüsleri, retrovirüsler ve HIV, viral zoonozlar ve ortaya çıkan patojenler. Klinik yönetim rehberliği sağlamamaktadır.
Alt konular
Temel sorular
- Genom tipi (DNA'ya karşı RNA, tek sarmallı'ya karşı çift sarmallı, pozitif polariteli'ye karşı negatif polariteli) bir virüsün replikasyon stratejisini nasıl belirlemektedir?
- Başlıca insan enfeksiyon hastalıklarından hangi viral aileler sorumludur?
- Bazı virüsler neden latensiye, diğerleri hızlı antijenik değişime ve bazıları da zoonotik ortaya çıkışa eğilimlidir?
Anahtar kavramlar
- Genom tipi ve Baltimore sınıfı
- Replikasyon stratejisi ve haberci RNA (messenger-RNA) sentezi
- Zarflı'ya karşı zarfsız viryonlar
- Latensi (latency) ve kalıcılık
- Antijenik varyasyon
- Zoonotik yayılma (spillover) ve ortaya çıkış
- Konakçı aralığı ve tropizm
Temel kuramlar
- Baltimore sınıflandırması
- David Baltimore, virüsleri genomlarının doğasına ve haberci RNA (messenger RNA) üretme yollarına göre tanımlanan sınıflara ayırmayı önermiştir; bu, viral taksonomiyi konakçı veya semptom yerine replikasyon stratejisi etrafında birleştiren bir şemadır.
Mekanizmalar
Viral aileler, genomlarının viral proteinlerin ve yavru genomların sentezini nasıl yönlendirdiği ile ayırt edilmektedir. Baltimore'ın şeması bu çeşitliliği sınıflara ayırmaktadır: çift sarmallı DNA virüsleri, genomu doğrudan haberci RNA (messenger RNA) olarak işlev gören pozitif polariteli RNA virüsleri, önce tamamlayıcı bir mesajı transkribe etmesi gereken negatif polariteli RNA virüsleri ve RNA genomlarını entegrasyon için DNA'ya ters transkribe eden retrovirüsler. Genom kimyası, sonraki davranışları şekillendirmektedir: birçok DNA virüsü yaşam boyu süren latensi (latency) oluşturmakta, RNA virüsleri yüksek mutasyon oranlarına ve antijenik değişime eğilim göstermekte ve hayvan rezervuarları, bazı ailelerin insanlara yayılmasına (spill over) olanak tanımaktadır.
Klinik önem
Viral patojenlerin sınıflandırılması, klinisyenlerin ve mikrobiyologların enfeksiyon hastalıklarında tanı, bulaşma ve önleme hakkında nasıl akıl yürüttüğünün temelini oluşturmaktadır. Bir virüsün hangi aileye ait olduğunu anlamak, onun karakteristik hastalık seyrini ve antiviral ve aşı stratejilerinin genel mantığını açıklamaya yardımcı olmaktadır. Bu alan, viral patojenlerin nasıl organize edildiğini ve incelendiğini açıklamakta olup, bireysel tanı veya tedavi kararları için bir temel oluşturmamaktadır.
Epidemiyoloji
İnsan viral patojenleri, endemik, epidemik ve pandemik kalıpları sergilemekte olup, ortaya çıkan insan enfeksiyonlarının büyük bir kısmı, vahşi yaşam rezervuarlarından zoonozlar olarak kaynaklanmaktadır; bu, son yıllardaki ortaya çıkan hastalık sürveyansı (surveillance) boyunca belgelenmiş bir eğilimdir.
Kanıt ve kılavuzlar
Virolojideki Fields Virology ve Principles of Virology gibi standart referans eserler, burada özetlenen konsensüs taksonomiyi ve hastalık ilişkilerini sağlamaktadır; sürveyans çalışmaları, zoonotik ve ortaya çıkan virüslerin insan hastalık yüküne artan katkısını belgelemektedir.
Tarihçe
Viral taksonomi, yirminci yüzyılda konakçı ve hastalığa dayalı tanımlamalardan moleküler bir çerçeveye doğru ilerlemiştir. Baltimore'ın 1971'deki genom tipine göre sınıflandırması bir birleştirici ilke haline gelmiş, sonraki on yıllar her aileyi kendine özgü insan hastalıklarıyla ilişkilendirmiş, ortaya çıkan hastalık araştırmaları ise birçok yeni viral tehdidin vahşi yaşam kökenlerini vurgulamıştır.
Öne çıkan isimler
- David Baltimore
- Howard Temin
- Vincent Racaniello
- Peter Daszak
İlgili konular
Temel eserler
- baltimore-1971
- knipe-fields-2013
- jones-2008
Sıkça sorulan sorular
- Virüsler ailelere nasıl sınıflandırılmaktadır?
- Modern viroloji, virüsleri genomlarının kimyasal yapısına ve bu genomun haberci RNA'yı nasıl ürettiğine ve çoğaldığına göre, Baltimore sınıflandırmasının temelini oluşturan prensiplerle birlikte, zarfın varlığı gibi yapısal özelliklerin yanı sıra gruplandırmaktadır.
- RNA virüsleri neden bu kadar çok ortaya çıkan hastalığa neden olmaktadır?
- RNA virüsleri genellikle hızla mutasyona uğramakta ve birçoğu hayvan rezervuarlarını sürdürmektedir; bu durumlar birlikte antijenik değişimi ve insan popülasyonlarına zoonotik yayılımı (spillover) desteklemektedir.