Genetik Bağlantı
Genetik bağlantı, aynı kromozom üzerinde birbirine yakın konumlanan loküslerdeki alellerin, şansa bağlı beklenenden daha sık birlikte kalıtılma eğilimidir. Bu durum, Mendel'in bağımsız açılım yasasının bir istisnasıdır ve genlerin, yakın belirteçlerin aileler aracılığıyla ne sıklıkta birlikte aktarıldığı takip edilerek haritalanmasını mümkün kılan bir özelliktir.
Tanım
Genetik bağlantı, aynı kromozom üzerinde bulunan iki veya daha fazla loküsteki alellerin, bağımsız açılımın öngördüğünden daha yüksek bir frekansta birlikte kalıtılmasıdır; bu durum, onların fiziksel yakınlığını ve mayoz sırasında rekombinasyonun onları ayırma olasılığının düşük olmasını yansıtmaktadır.
Kapsam
Bu madde, bağlantının ne olduğunu, neden bağımsız açılımdan saptığını, bunu nicelendiren rekombinasyon fraksiyonunu ve insan soyağaçlarında bağlantıyı test etmek için kullanılan LOD-skoru çerçevesini kapsamaktadır. Bağlantıyı, klinik bir test olarak değil, aktarım ve tıbbi genetikte bir referans kavramı olarak ele almaktadır.
Temel sorular
- İki loküs ne zaman bağımsız olarak açılır ve ne zaman bağlıdır?
- Bağlantının gücü nasıl nicelendirilir?
- Bir belirteç ile bir hastalık loküsü arasındaki bağlantı, bir hastalık genini nasıl lokalize edebilir?
Anahtar kavramlar
- Bağlantı ve bağımsız açılım
- Rekombinasyon fraksiyonu (teta)
- Bağlanma (cis) ve itme (trans) fazı
- LOD skoru
- Soyağaçlarında bağlantı analizi
- Belirteç loküsleri
Mekanizmalar
Mendel'in bağımsız açılım yasası, farklı kromozomlar üzerindeki veya aynı kromozom üzerinde birbirinden uzakta bulunan loküsler için geçerlidir, çünkü taşıdıkları aleller gametlere bağımsız olarak ayrılmaktadır. İki loküs bir kromozom üzerinde birbirine yakın konumlandığında, aralarına nadiren bir krossing-over düşmektedir; bu nedenle, ebeveyn alel kombinasyonları genellikle bozulmadan aktarılmakta ve rekombinant kombinasyonlar nadir görülmektedir. Loküsler arasında rekombinant olan mayozların oranı olan rekombinasyon fraksiyonu (teta), sıkıca bağlı loküsler için 0'a yakın değerlerden, bağlantısız loküsler için 0.5'e kadar değişmektedir. Kontrollü çaprazlamaların mümkün olmadığı insan genetiğinde, bağlantı istatistiksel olarak tespit edilmektedir: Morton (1955) tarafından tanıtılan LOD skoru, aile verilerinin belirli bir rekombinasyon fraksiyonu altındaki olasılığını, bağlantı olmaması durumundaki olasılıkla karşılaştırmaktadır; LOD skoru 3 değeri, geleneksel olarak bağlantının kanıtı olarak kabul edilmektedir.
Klinik önem
Bir genetik belirteç ile bir hastalık loküsü arasındaki bağlantı, aile temelli gen lokalizasyonunun temelini oluşturmaktadır; bir soyağacında hangi belirteç alellerinin hastalıkla birlikte ayrıldığını takip etmek, bir hastalık geninin bulunduğu kromozomal bölgeye işaret edebilmektedir. Bu durum, gen lokasyonu için araştırma kanıtlarının nasıl üretildiğini açıklamaktadır ve tanısal veya tedavi önerisi niteliğinde olmayıp, referans niteliğinde bir arka plan bilgisidir.
Tarihçe
Bağlantı ilk olarak çaprazlamaların bağımsız açılımı ihlal etmesiyle fark edilmiş ve Morgan'ın grubu bunu genlerin kromozomlar üzerindeki fiziksel birlikteliği olarak yorumlamıştır. Sturtevant (1913), bağlı Drosophila faktörleri arasındaki rekombinasyon frekanslarını ilk doğrusal genetik haritaya dönüştürmüştür. Deneysel çaprazlamaların mümkün olmadığı insan soyağaçları için Morton (1955), bağlantıyı tespit etmek ve moleküler belirteçlerle insan hastalık genlerini lokalize etmek için standart yöntem haline gelen sıralı LOD-skoru testini geliştirmiştir.
Öne çıkan isimler
- Thomas Hunt Morgan
- Alfred Sturtevant
- Newton Morton
- Jurg Ott
İlgili konular
Temel eserler
- sturtevant-1913
- morton-1955
Sıkça sorulan sorular
- Hangi rekombinasyon fraksiyonu iki loküsün bağlantısız olduğu anlamına gelir?
- 0.5'lik bir rekombinasyon fraksiyonu, rekombinant ve rekombinant olmayan gametlerin eşit sıklıkta olduğunu göstermektedir; bu durum, bağımsız açılımın ürettiği sonuçtur, dolayısıyla loküsler etkin bir şekilde bağlantısızdır.
- 3'lük bir LOD skoru ne anlama gelir?
- Bu, test edilen rekombinasyon fraksiyonunda bağlantı lehine 1000'e 1 oranında bir olasılığa karşılık gelmektedir ve bir soyağacı çalışmasında anlamlı bağlantıyı ilan etmek için geleneksel eşik değeridir.