การวิเคราะห์สายวิวัฒนาการแบบเบย์เซียน — การอนุมานต้นไม้สายวิวัฒนาการด้วย MCMC
การวิเคราะห์สายวิวัฒนาการแบบเบย์เซียน (Bayesian phylogenetic analysis) ใช้ทฤษฎีบทของเบย์ (Bayes' theorem) และการสุ่มตัวอย่างแบบลูกโซ่มาร์คอฟมอนติคาร์โล (Markov chain Monte Carlo หรือ MCMC) เพื่อประมาณการแจกแจงความน่าจะเป็นภายหลัง (posterior probability distribution) ของต้นไม้สายวิวัฒนาการและพารามิเตอร์ของแบบจำลอง โดยพิจารณาจากข้อมูลลำดับที่สังเกตได้ ซึ่งแตกต่างจากวิธีการหาค่าความเป็นไปได้สูงสุด (maximum-likelihood) ที่ใช้บูตสแตรป (bootstrap) ซึ่งให้ต้นไม้ที่ดีที่สุดเพียงต้นเดียว การอนุมานแบบเบย์เซียนจะให้ชุดต้นไม้ที่น่าเชื่อถือ (credible set) พร้อมกับความน่าจะเป็นภายหลังที่เกี่ยวข้อง ซึ่งเป็นมาตรวัดความไม่แน่นอนทางสายวิวัฒนาการที่เป็นหลักการ เป็นกรอบการทำงานหลักในการประมาณเวลาการแยกสาย (divergence times) และความสัมพันธ์ของบรรพบุรุษในการวิวัฒนาการระดับโมเลกุล
อ่านวิธีฉบับเต็ม
เข้าสู่ระบบด้วยบัญชีฟรีเพื่ออ่านส่วนนี้
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
แหล่งอ้างอิง
- Ronquist, F., & Huelsenbeck, J. P. (2003). MrBayes 3: Bayesian phylogenetic inference under mixed models. Bioinformatics, 19(12), 1572–1574. DOI: 10.1093/bioinformatics/btg180 ↗
- Drummond, A. J., & Rambaut, A. (2007). BEAST: Bayesian evolutionary analysis by sampling trees. BMC Evolutionary Biology, 7(1), 214. DOI: 10.1186/1471-2148-7-214 ↗
วิธีอ้างอิงหน้านี้
ScholarGate. (2026, June 3). Bayesian Phylogenetic Analysis using Markov Chain Monte Carlo. ScholarGate. https://scholargate.app/th/bioinformatics/bayesian-phylogenetic-analysis
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
- การศึกษาความสัมพันธ์ทั่วทั้งจีโนมแบบเบย์ชีวสารสนเทศศาสตร์↔ compare
- การวิเคราะห์วิวัฒนาการชาติพันธุ์ชีวสารสนเทศศาสตร์↔ compare
- การจัดเรียงลำดับชีวสารสนเทศศาสตร์↔ compare