ScholarGate
Assistent
Process / pipelineBioinformatics / omics

Anrop av toppar i enkelcells-ChIP-seq — Epigenomisk profilering med scChIP-seq

Anrop av toppar i enkelcells-ChIP-seq är en bioinformatisk pipeline som identifierar genomiska regioner anrikade för histonmodifieringar eller transkriptionsfaktorbindning i enskilda celler. Genom att profilera kromatinets tillstånd med enkelcells-upplösning avslöjar den epigenomisk heterogenitet dold i bulk-ChIP-seq-experiment, vilket gör det möjligt för forskare att kartlägga regulatoriska landskap över distinkta cellpopulationer inom ett komplext vävnadsprov.

Öppna i MethodMindSnartVideoSnartDownload slides

Läs hela metoden

Endast för medlemmar

Logga in med ett kostnadsfritt konto för att läsa avsnittet.

Logga in

Method map

The neighbourhood of related methods — select a node to explore.

Källor

  1. Grosselin, K., Durand, A., Marsolier, J., Poitou, A., Marangoni, E., Nemati, F., ... & Vallot, C. (2019). High-throughput single-cell ChIP-seq identifies heterogeneity of chromatin states in breast cancer. Nature Genetics, 51(6), 1060-1066. link
  2. Ku, W. L., Nakamura, K., Gao, W., Cui, K., Hu, G., Tang, Q., ... & Zhao, K. (2019). Single-cell chromatin immunocleavage sequencing (scChIC-seq) to profile histone modification. Nature Methods, 16(4), 323-325. link

Så citerar du den här sidan

ScholarGate. (2026, June 3). Single-cell Chromatin Immunoprecipitation Sequencing Peak Calling. ScholarGate. https://scholargate.app/sv/bioinformatics/single-cell-chip-seq-peak-calling

Which method?

Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.

Compare side by side
ScholarGateSingle-cell ChIP-seq peak calling (Single-cell Chromatin Immunoprecipitation Sequencing Peak Calling). Hämtad 2026-06-15 från https://scholargate.app/sv/bioinformatics/single-cell-chip-seq-peak-calling · Datamängd: https://doi.org/10.5281/zenodo.20539026