Перейти к содержимомуScholarGate
БиблиотекаМоя библиотекаСтолReview StudioАссистент
Войти
Single-cell RNA-seq analysis/Доказательство
Запись доказательств метода

Single-cell RNA-seq analysis

Single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) analysis characterises gene expression at the resolution of individual cells, enabling discovery of cell types, states, and transitions that are invisible in bulk transcriptomics. Starting from raw sequencing reads, the workflow produces a cell-by-gene count matrix and proceeds through quality control, normalisation, dimensionality reduction, unsupervised clustering, cell-type annotation, and a range of downstream analyses such as trajectory inference and differential expression between cell populations.

Sources recorded, not reviewed

Исходная запись

Цитирование скопировано дословно из исходной записи метода. На его основании не делается никаких выводов о проверке на уровне утверждения.

Single-cell RNA Sequencing Analysis
Таксономическая запись метода · process-pipeline / bioinformatics
  • Satija, R., Farrell, J. A., Gennert, D., Schier, A. F., & Regev, A. (2015). Spatial reconstruction of single-cell gene expression data. Nature Biotechnology, 33(5), 495–502. · DOI 10.1038/nbt.3192
  • Macosko, E. Z., Basu, A., Satija, R., Nemesh, J., Shekhar, K., Goldman, M., ... & McCarroll, S. A. (2015). Highly parallel genome-wide expression profiling of individual cells using nanoliter droplets. Cell, 161(5), 1202–1214. · DOI 10.1016/j.cell.2015.05.002
Открыть полный метод

Курируемые утверждения

Утверждения сохранены в реестре доказательств, каждое со своей оценкой.

Курируемых утверждений еще нет

Этот вид не создает оценку утверждения, если в реестре ее нет.

Связанные методы

Сгенерировано из графа методов и показано как предложенные машиной связи — никаких выводов об утверждениях доказательств не делается.

Taxonomic bucketGene Set Enrichment Analysismachine-suggested · Relational suggestion, not evidence.Taxonomic bucketPathway Enrichment Analysismachine-suggested · Relational suggestion, not evidence.Taxonomic bucketRNA-seq Differential Expressionmachine-suggested · Relational suggestion, not evidence.Taxonomic bucketSingle-cell eQTL analysismachine-suggested · Relational suggestion, not evidence.Taxonomic bucketSingle-cell variant callingmachine-suggested · Relational suggestion, not evidence.

Статус доказательств

Sources recorded, not reviewed

Bibliographic sources are present. Claim-level evidence review has not been performed.

Источники

2 зарегистрированных цитирований, скопированных из исходной записи метода.

Действия

Открыть страницу метода
ScholarGate

Справочная библиотека исследовательских методов, где главное — содержание: что представляет собой каждый метод, как он работает и откуда происходит.

Открытые данные (CC-BY)

Обзор

  • Библиотека
  • Поиск методов…
  • Обзор по областям
  • Области
  • Путь
  • Сравнить
  • Какой метод выбрать?

Справочник

  • Дисциплины
  • Атлас
  • Глоссарий
  • Методология
  • Философия

Рабочее пространство

  • Моя библиотека
  • Стол
  • Чат

Компания

  • О проекте
  • Цены
  • Контакты
  • Предложить метод

Материалы составлены из опубликованных источников и приведены для справки. Проверка точности и применимости любых сведений для ваших целей остаётся вашей ответственностью.

© 2026 ScholarGate · Справочная библиотека исследовательских методов
  • Конфиденциальность
  • Куки
  • Условия использования
  • Удалить аккаунт