Байесовский анализ разнообразия микробиома — вероятностная оценка структуры сообщества

Байесовский анализ разнообразия микробиома применяет вероятностные модели — главным образом, Дирихле-Многомерное распределение и связанные с ним иерархические структуры — к данным подсчетов 16S рРНК или полногеномного метагеномного секвенирования для оценки альфа-разнообразия (богатство и равномерность внутри выборки) и бета-разнообразия (композиционные различия между выборками) с учетом неопределенности на всех этапах вывода. В отличие от частотных подходов, основанных на разрежении (rarefaction), байесовские методы рассматривают подсчеты таксонов как выборки из скрытой композиции, что позволяет получать доверительные интервалы для метрик разнообразия и обоснованно сравнивать группы с неравной глубиной секвенирования.