Analiza ecranelor CRISPR
Analiza ecranelor CRISPR procesează date din screening-uri genetice agregate utilizând CRISPR-Cas9 pentru a identifica genele necesare pentru creșterea, supraviețuirea celulară sau fenotipuri în condiții specifice. Dezvoltat de Zhang, Sanjana și colaboratori, acest pipeline computațional transformă citirile de secvențiere ale abundenței ARN-urilor ghid în liste clasificate de gene funcționale.
Citește metoda completă
Autentifică-te cu un cont gratuit pentru a citi această secțiune.
Harta metodelor
Vecinătatea metodelor înrudite — selectați un nod pentru a explora.
Surse
- Shalem, O., Sanjana, N. E., Hartenian, E., Shi, X., Scott, D. A., Mikkelsen, T. S., ... & Zhang, F. (2014). Genome-scale CRISPR-Cas9 knockout screening in human cells. Science, 343(6166), 84-87. DOI: 10.1126/science.1247005 ↗
- Hart, T., Chandrashekhar, M., Aregger, M., Steinhart, Z., Brown, K. R., MacLeod, G., ... & Moffat, J. (2015). High-resolution CRISPR screens reveal fitness genes and pathways. Molecular Systems Biology, 11(8), 820. link ↗
- King, J. B., Palmer, A. C., & Sorger, P. K. (2020). Application of a genetic algorithm designed for flexible objective optimization in pharmaceutical research and development. Cancer Research, 79(13 Supplement), 3435. link ↗
Cum se citează această pagină
ScholarGate. (2026, June 3). CRISPR Screening Data Analysis and Hit Identification. ScholarGate. https://scholargate.app/ro/bioinformatics/crispr-screen-analysis
Ce metodă?
Așezați această metodă lângă cele mai apropiate rude și citiți-le alăturat — biblioteca pune cărțile pe masă; alegerea vă aparține.
- Asamblare de novo a transcriptomuluiBioinformatică↔ compară
- Căutare Profil HMMERBioinformatică↔ compară
- Binarea MetagenomicăBioinformatică↔ compară
Citat de
Similar methods
Ai observat o problemă pe această pagină? Raportează sau sugerează o corectură →