Binarea Metagenomică
Binarea metagenomică partitionează contigurile asamblate din comunități microbiene complexe în "bin-uri" genomice distincte, fiecare reprezentând un organism sau o tulpină individuală. Pionierată de Banfield și colegii săi, această metodologie izolează genomuri de organisme unice (genomuri asamblate metagenomic sau MAG-uri) din probe de mediu fără a necesita izolate cultivate.
Citește metoda completă
Autentifică-te cu un cont gratuit pentru a citi această secțiune.
Harta metodelor
Vecinătatea metodelor înrudite — selectați un nod pentru a explora.
Surse
- Kang, D. D., Froula, J., Egan, R., & Wang, Z. (2015). MetaBAT, an efficient tool for accurately reconstructing single genomes from complex microbial communities. PeerJ, 3, e1165. DOI: 10.7717/peerj.1165 ↗
- Jain, C., Rodriguez-R, L. M., Phillippy, A. M., Konstantinidis, K. T., & Aluru, S. (2018). High throughput ANI analysis of 90K prokaryotic genomes reveals clear species boundaries. Nature Communications, 9(1), 4045. DOI: 10.1038/s41467-018-07641-9 ↗
- Sieber, C. M. K., Probst, A. J., Sharrar, A., Thomas, B. C., Hess, M., Tringe, S. G., & Banfield, J. F. (2018). Recovery of genomes from metagenomes via a dereplication, aggregation and scoring strategy. Nature Microbiology, 3(7), 836-843. DOI: 10.1038/s41564-018-0171-1 ↗
Cum se citează această pagină
ScholarGate. (2026, June 3). Metagenome Assembly and Genome Binning. ScholarGate. https://scholargate.app/ro/bioinformatics/metagenomic-binning
Ce metodă?
Așezați această metodă lângă cele mai apropiate rude și citiți-le alăturat — biblioteca pune cărțile pe masă; alegerea vă aparține.
- Analiza ecranelor CRISPRBioinformatică↔ compară
- Asamblare de novo a transcriptomuluiBioinformatică↔ compară
- Căutare Profil HMMERBioinformatică↔ compară
Citat de
Ai observat o problemă pe această pagină? Raportează sau sugerează o corectură →