ScholarGate
Asistent
Process / pipelineBioinformatics / omics

Apelarea vârfurilor ChIP-seq — Apelarea vârfurilor prin secvențiere prin imunoprecipitare a cromatinei

Apelarea vârfurilor ChIP-seq este o conductă computațională care identifică regiunile genomice unde o proteină de interes — un factor de transcripție sau o modificare a histonelor — este îmbogățită, pe baza citirilor de secvențiere din experimente de imunoprecipitare a cromatinei. Aceasta convertește datele brute de secvențiere într-un set de situsuri de legare sau de modificare de înaltă încredere pe întregul genom, permițând analiza ulterioară a reglării genice, a stării cromatinei și a mecanismelor epigenetice.

Deschide în MethodMindÎn curândVideoÎn curândDownload slides

Citește metoda completă

Doar pentru membri

Autentifică-te cu un cont gratuit pentru a citi această secțiune.

Autentificare

Method map

The neighbourhood of related methods — select a node to explore.

Apelarea vârfurilor ChIP-seq
Analiza ATAC-seqStudiu de asociere la ni…Expresia Diferențială RN…Aliniere de secvențeAnaliza ARN-seq monocelu…Variant CallingBayesian ChIP-seq Peak C…Apelarea diferențială a…Studiu de Asociație Epig…Apelarea vârfurilor ChIP…

+3 more

Surse

  1. Zhang, Y., Liu, T., Meyer, C. A., Eeckhoute, J., Johnson, D. S., Bernstein, B. E., Nusbaum, C., Myers, R. M., Brown, M., Li, W., & Liu, X. S. (2008). Model-based analysis of ChIP-seq (MACS). Genome Biology, 9(9), R137. DOI: 10.1186/gb-2008-9-9-r137 ↗
  2. Landt, S. G., Marinov, G. K., Kundaje, A., Kheradpour, P., Pauli, F., Batzoglou, S., Bernstein, B. E., Bickel, P., Brown, J. B., Cayting, P., Chen, Y., DeSalvo, G., Epstein, C., Fisher-Aylor, K. I., Euskirchen, G., Gerstein, M., Gertz, J., Hartemink, A. J., Hoffman, M. M., ... Snyder, M. (2012). ChIP-seq guidelines and practices of the ENCODE and modENCODE consortia. Genome Research, 22(9), 1813–1831. DOI: 10.1101/gr.136184.111 ↗

Cum se citează această pagină

ScholarGate. (2026, June 3). Chromatin Immunoprecipitation Sequencing Peak Calling. ScholarGate. https://scholargate.app/ro/bioinformatics/chip-seq-peak-calling

Which method?

Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.

Compare side by side →

Citat de

Bayesian ChIP-seq Peak CallingApelarea diferențială a vârfurilor ChIP-seqStudiu de Asociație Epigenomică la Nivel de Genom DiferențialStudiu de asociere la nivel de epigenom (EWAS)Apelarea vârfurilor ChIP-seq asistată de învățare automatăAnaliza Multi-Omics Single-Cell RNA-seqExpresia Diferențială RNA-seqAliniere de secvențeApelarea vârfurilor în ChIP-seq pe celulă unicăApelarea vârfurilor ChIP-seq în serii temporale

Ai observat o problemă pe această pagină? Raportează sau sugerează o corectură →

ScholarGate — ChIP-seq Peak Calling (Chromatin Immunoprecipitation Sequencing Peak Calling). Preluat la 2026-06-15 de pe https://scholargate.app/ro/bioinformatics/chip-seq-peak-calling · Set de date: https://doi.org/10.5281/zenodo.20539026