Bayesian ChIP-seq Peak Calling — Detecția Probabilistică a Îmbogățirii în Date Epigenomice

Apelarea bayesiană a vârfurilor ChIP-seq aplică modele probabilistice — de obicei modele Poisson, binomiale negative sau Markov ascunse cu inferență bayesiană — pentru a detecta regiuni genomice îmbogățite pentru o proteină de interes în experimente de imunoprecipitare a cromatinei urmată de secvențiere. Prin modelarea explicită a zgomotului numărului de citiri și prin încorporarea distribuțiilor a priori, apelatorii bayesieni generează probabilități a posteriori de îmbogățire, mai degrabă decât valori p simple, oferind un cadru principial pentru cuantificarea incertitudinii pe întregul genom.