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Time-series single-cell RNA-seq analysis/Evidência
Registro de evidência do método

Time-series single-cell RNA-seq analysis

Time-series single-cell RNA-seq analysis captures gene expression across multiple time points at single-cell resolution to reveal how cell populations emerge, transition, and diverge during dynamic biological processes such as development, differentiation, or disease progression. By combining pseudotime ordering, RNA velocity, and differential dynamics testing, researchers reconstruct the temporal trajectory of individual cells and identify the gene regulatory changes that drive biological transitions.

Sources recorded, not reviewed

Registro de origem

Citações copiadas literalmente do registro de origem do método. Nenhuma verificação em nível de alegação é inferida delas.

Time-Series Single-Cell RNA Sequencing Analysis
Registro de método taxonômico · process-pipeline / bioinformatics
  • Trapnell, C., Cacchiarelli, D., Grimsby, J., Pokharel, P., Li, S., Morse, M., Lennon, N. J., Livak, K. J., Mikkelsen, T. S., & Rinn, J. L. (2014). The dynamics and regulators of cell fate decisions are revealed by pseudotemporal ordering of single cells. Nature Biotechnology, 32(4), 381-386. · DOI 10.1038/nbt.2859
  • La Manno, G., Soldatov, R., Zeisel, A., Braun, E., Hochgerner, H., Petukhov, V., Lidschreiber, K., Kastriti, M. E., Lonnerberg, P., Furlan, A., Fan, J., Borm, L. E., Liu, Z., van Bruggen, D., Guo, J., He, X., Linnarsson, S., & Kharchenko, P. V. (2018). RNA velocity of single cells. Nature, 560(7719), 494-498. · DOI 10.1038/s41586-018-0414-6
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Alegações curadas

Alegações persistidas no livro-razão de evidências, cada uma com sua própria avaliação.

Ainda não há alegações curadas

Esta visualização não inventa uma avaliação de alegação quando o livro-razão não a possui.

Métodos relacionados

Gerado a partir do grafo de métodos e mostrado como relações sugeridas por máquina — nenhuma alegação de evidência é inferida.

Taxonomic bucketCopy Number Variation Analysismachine-suggested · Relational suggestion, not evidence.Taxonomic bucketeQTL Analysismachine-suggested · Relational suggestion, not evidence.Taxonomic bucketGene Set Enrichment Analysismachine-suggested · Relational suggestion, not evidence.Taxonomic bucketPathway Enrichment Analysismachine-suggested · Relational suggestion, not evidence.Taxonomic bucketRNA-seq Differential Expressionmachine-suggested · Relational suggestion, not evidence.Taxonomic bucketSingle-cell RNA-seq analysismachine-suggested · Relational suggestion, not evidence.

Status da evidência

Sources recorded, not reviewed

Bibliographic sources are present. Claim-level evidence review has not been performed.

Fontes

2 citações registradas, copiadas do registro de origem do método.

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