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Network-based single-cell RNA-seq analysis/Evidência
Registro de evidência do método

Network-based single-cell RNA-seq analysis

Network-based single-cell RNA-seq analysis extends standard scRNA-seq workflows by constructing and interrogating molecular interaction networks — gene regulatory networks, co-expression networks, or cell-cell communication graphs — from single-cell transcriptomic data. Rather than treating each gene independently, this approach captures the coordinated activity of gene circuits and intercellular signalling pathways within and between cell populations, enabling a systems-level view of transcriptional regulation at single-cell resolution.

Sources recorded, not reviewed

Registro de origem

Citações copiadas literalmente do registro de origem do método. Nenhuma verificação em nível de alegação é inferida delas.

Network-based Single-Cell RNA Sequencing Analysis
Registro de método taxonômico · process-pipeline / bioinformatics
  • Aibar, S., González-Blas, C. B., Moerman, T., Huynh-Thu, V. A., Imrichova, H., Hulselmans, G., ... & Aerts, S. (2017). SCENIC: single-cell regulatory network inference and clustering. Nature Methods, 14(11), 1083–1086. · URL
  • Jin, S., Guerrero-Juarez, C. F., Zhang, L., Chang, I., Ramos, R., Kuan, C. H., ... & Nie, Q. (2021). Inference and analysis of cell-cell communication using CellChat. Nature Communications, 12(1), 1088. · URL
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Alegações curadas

Alegações persistidas no livro-razão de evidências, cada uma com sua própria avaliação.

Ainda não há alegações curadas

Esta visualização não inventa uma avaliação de alegação quando o livro-razão não a possui.

Métodos relacionados

Gerado a partir do grafo de métodos e mostrado como relações sugeridas por máquina — nenhuma alegação de evidência é inferida.

Taxonomic bucketGene Set Enrichment Analysismachine-suggested · Relational suggestion, not evidence.Taxonomic bucketNetwork-based RNA-seq differential expressionmachine-suggested · Relational suggestion, not evidence.Taxonomic bucketPathway Enrichment Analysismachine-suggested · Relational suggestion, not evidence.Taxonomic bucketRNA-seq Differential Expressionmachine-suggested · Relational suggestion, not evidence.Taxonomic bucketSingle-cell eQTL analysismachine-suggested · Relational suggestion, not evidence.Taxonomic bucketSingle-cell RNA-seq analysismachine-suggested · Relational suggestion, not evidence.

Status da evidência

Sources recorded, not reviewed

Bibliographic sources are present. Claim-level evidence review has not been performed.

Fontes

2 citações registradas, copiadas do registro de origem do método.

Ações

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