Network-based gene set enrichment analysis
Network-based gene set enrichment analysis (network GSEA) extends classical GSEA by incorporating biological interaction networks — such as protein-protein interaction (PPI) or co-expression graphs — into the enrichment test. Instead of treating each gene independently, the method propagates differential expression signals across network edges, allowing genes that are co-regulated or functionally connected to jointly support the significance of a gene set. The result is a biologically coherent enrichment score that accounts for pathway topology and gene-gene dependencies.
Registro de origem
Citações copiadas literalmente do registro de origem do método. Nenhuma verificação em nível de alegação é inferida delas.
- Shojaie, A., & Michailidis, G. (2010). Network enrichment analysis in complex experiments. Statistical Applications in Genetics and Molecular Biology, 9(1), Article 22. · URL
- Subramanian, A., Tamayo, P., Mootha, V. K., Mukherjee, S., Ebert, B. L., Gillette, M. A., Paulovich, A., Pomeroy, S. L., Golub, T. R., Lander, E. S., & Mesirov, J. P. (2005). Gene set enrichment analysis: A knowledge-based approach for interpreting genome-wide expression profiles. Proceedings of the National Academy of Sciences, 102(43), 15545-15550. · URL
Alegações curadas
Alegações persistidas no livro-razão de evidências, cada uma com sua própria avaliação.
Esta visualização não inventa uma avaliação de alegação quando o livro-razão não a possui.
Métodos relacionados
Gerado a partir do grafo de métodos e mostrado como relações sugeridas por máquina — nenhuma alegação de evidência é inferida.