Gå til innholdScholarGate
BibliotekMitt bibliotekPultenReview StudioAssistent
Logg inn
Single-cell ChIP-seq peak calling/Bevis
Metodebevisregister

Single-cell ChIP-seq peak calling

Single-cell ChIP-seq peak calling is a bioinformatics pipeline that identifies genomic regions enriched for histone modifications or transcription factor binding in individual cells. By profiling chromatin states at single-cell resolution, it reveals epigenomic heterogeneity hidden in bulk ChIP-seq experiments, enabling researchers to map regulatory landscapes across distinct cell populations within a complex tissue sample.

Sources recorded, not reviewed

Kilderegister

Siteringer kopiert ordrett fra metodens kilderegister. Ingen påstandsnivåverifisering er underforstått fra dem.

Single-cell Chromatin Immunoprecipitation Sequencing Peak Calling
Taksonomisk metoderegister · process-pipeline / bioinformatics
  • Grosselin, K., Durand, A., Marsolier, J., Poitou, A., Marangoni, E., Nemati, F., ... & Vallot, C. (2019). High-throughput single-cell ChIP-seq identifies heterogeneity of chromatin states in breast cancer. Nature Genetics, 51(6), 1060-1066. · URL
  • Ku, W. L., Nakamura, K., Gao, W., Cui, K., Hu, G., Tang, Q., ... & Zhao, K. (2019). Single-cell chromatin immunocleavage sequencing (scChIC-seq) to profile histone modification. Nature Methods, 16(4), 323-325. · URL
Åpne full metode

Kuraterte påstander

Påstander lagret i bevishovedboken, hver med sin egen vurdering.

Ingen kuraterte påstander ennå

Denne visningen finner ikke opp en påstandsvurdering når hovedboken ikke har noen.

Relaterte metoder

Generert fra metodegrafen og vist som maskinforslåtte relasjoner – ingen bevispåstand er underforstått.

Taxonomic bucketChIP-seq Peak Callingmachine-suggested · Relational suggestion, not evidence.Taxonomic bucketEpigenome-wide association studymachine-suggested · Relational suggestion, not evidence.Taxonomic bucketSingle-cell epigenome-wide association studymachine-suggested · Relational suggestion, not evidence.Taxonomic bucketSingle-cell RNA-seq analysismachine-suggested · Relational suggestion, not evidence.Taxonomic bucketSingle-cell sequence alignmentmachine-suggested · Relational suggestion, not evidence.

Bevisstatus

Sources recorded, not reviewed

Bibliographic sources are present. Claim-level evidence review has not been performed.

Kilder

2 registrerte siteringer, kopiert fra metodens kilderegister.

Handlinger

Åpne metodeside
ScholarGate

Et innholdsfokusert oppslagsbibliotek for forskningsmetoder — hva hver metode er, hvordan den fungerer, og hvor den kommer fra.

Åpne data (CC-BY)

Oppdag

  • Bibliotek
  • Søk i metoder…
  • Bla etter fagfelt
  • Fagfelt
  • Reise
  • Sammenlign
  • Hvilken metode?

Referanse

  • Fagområder
  • Atlas
  • Ordliste
  • Metodikk
  • Filosofi

Arbeidsområde

  • Mitt bibliotek
  • Pulten
  • Chat

Selskap

  • Om
  • Priser
  • Kontakt
  • Foreslå en metode

Oppføringene er sammenstilt fra publiserte kilder til referansebruk. Å kontrollere at informasjonen er korrekt og egnet for ditt eget bruk, er fremdeles ditt eget ansvar.

© 2026 ScholarGate · Et oppslagsbibliotek for forskningsmetoder
  • Personvern
  • Informasjonskapsler
  • Vilkår
  • Slett konto