Single-cell ChIP-seq Peak Calling — scChIP-seq Epigenomic Profiling
Single-cell ChIP-seq peak calling is een bio-informatica pijplijn die genomische regio's identificeert die verrijkt zijn voor histonmodificaties of transcriptiefactorbinding in individuele cellen. Door chromatine-toestanden op single-cell resolutie te profileren, onthult het epigenomische heterogeniteit die verborgen zit in bulk ChIP-seq experimenten, waardoor onderzoekers regulatoire landschappen kunnen in kaart brengen over verschillende celpopulaties binnen een complex weefselmonster.
Lees de volledige methode
Log in met een gratis account om dit onderdeel te lezen.
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
Bronnen
- Grosselin, K., Durand, A., Marsolier, J., Poitou, A., Marangoni, E., Nemati, F., ... & Vallot, C. (2019). High-throughput single-cell ChIP-seq identifies heterogeneity of chromatin states in breast cancer. Nature Genetics, 51(6), 1060-1066. link ↗
- Ku, W. L., Nakamura, K., Gao, W., Cui, K., Hu, G., Tang, Q., ... & Zhao, K. (2019). Single-cell chromatin immunocleavage sequencing (scChIC-seq) to profile histone modification. Nature Methods, 16(4), 323-325. link ↗
Deze pagina citeren
ScholarGate. (2026, June 3). Single-cell Chromatin Immunoprecipitation Sequencing Peak Calling. ScholarGate. https://scholargate.app/nl/bioinformatics/single-cell-chip-seq-peak-calling
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
- ChIP-seq Peak CallingBio-informatica↔ compare
- Epigenoom-brede associatiestudie (EWAS)Bio-informatica↔ compare
- Single-cell epigenome-wide association study (scEWAS)Bio-informatica↔ compare
- Single-cell RNA-seq AnalyseBio-informatica↔ compare
- Single-cell sequentie-aligneringBio-informatica↔ compare
Een fout op deze pagina gezien? Meld het of stel een correctie voor →