Carian Profil HMMER
Carian profil HMMER mengenal pasti homolog jujukan protein yang jauh menggunakan model probabilistik keluarga protein, yang dikenali sebagai Model Markov Tersembunyi profil (HMM profil). Dibangunkan oleh Eddy dan rakan-rakan, kaedah ini menangkap corak variasi jujukan dalam keluarga protein dan mengesan homolog dengan kepekaan yang jauh lebih tinggi berbanding matriks berat kedudukan atau penjajaran pasangan.
Baca kaedah sepenuhnya
Log masuk dengan akaun percuma untuk membaca bahagian ini.
Peta kaedah
Kejiranan kaedah berkaitan — pilih satu nod untuk meneroka.
Sumber
- Krogh, A., Brown, M., Mian, I. S., Sjölander, K., & Haussler, D. (1994). Hidden Markov models in computational biology: applications to protein modeling. Journal of Molecular Biology, 235(5), 1501-1531. DOI: 10.1006/jmbi.1994.1104 ↗
- Eddy, S. R. (1998). Profile hidden Markov models. Bioinformatics, 14(9), 755-763. DOI: 10.1093/bioinformatics/14.9.755 ↗
- Finn, R. D., Clements, J., & Eddy, S. R. (2011). HMMER web server: interactive sequence similarity searching. Nucleic Acids Research, 39(Web Server issue), W29-W37. DOI: 10.1093/nar/gkr367 ↗
Cara memetik halaman ini
ScholarGate. (2026, June 3). Hidden Markov Model Profile Search for Sequence Homology. ScholarGate. https://scholargate.app/ms/bioinformatics/hmmer-profile-search
Kaedah yang mana?
Letakkan kaedah ini di sebelah kaedah yang paling rapat dengannya dan baca secara bersebelahan — perpustakaan menyusun buku di atas meja; pilihan terletak pada anda.
- Rekonstruksi Krio-EMBioinformatik↔ banding
- Pengasingan MetagenomikBioinformatik↔ banding
- Docking MolekularBioinformatik↔ banding
Dirujuk oleh
Terjumpa masalah pada halaman ini? Laporkan atau cadangkan pembetulan →