Process / pipelineTranscriptomics

Pemasangan Transkriptom De Novo

Pemasangan transkriptom de novo menyusun semula urutan asid ribonukleik pemesej penuh secara terus daripada bacaan jujukan tanpa memerlukan genom rujukan. Dipelopori oleh Regev, Haas, dan rakan-rakan, saluran paip ini membolehkan penemuan transkrip dalam organisma bukan model dan pengesanan isoform baharu, gen gabungan, dan varian sambatan.

Buka dalam MethodMindTidak lama lagiVideoTidak lama lagiMuat turun slaid

Baca kaedah sepenuhnya

Ahli sahaja

Log masuk dengan akaun percuma untuk membaca bahagian ini.

Log masuk

Peta kaedah

Kejiranan kaedah berkaitan — pilih satu nod untuk meneroka.

Pemasangan Transkriptom De Novo

Analisis Saringan CRISPR Carian Profil HMMER Pengasingan Metagenomik

Sumber

Grabherr, M. G., Haas, B. J., Yassour, M., Levin, J. Z., Thompson, D. A., Amit, I., ... & Regev, A. (2011). Full-length transcriptome assembly from RNA-Seq data without a reference genome. Nature Biotechnology, 29(7), 644-652. DOI: 10.1038/nbt.1883 ↗
Haas, B. J., Papanicolaou, A., Yassour, M., Grabherr, M., Blood, P. D., Bowden, J., ... & Regev, A. (2013). De novo transcript sequence reconstruction from RNA-seq using the Trinity platform for reference generation and analysis. Nature Protocols, 8(8), 1494-1512. DOI: 10.1038/nprot.2013.084 ↗
Pertea, M., Pertea, G. M., Antonescu, C. M., Chang, T. C., Mendell, J. T., & Salzberg, S. L. (2015). StringTie enables improved assembly of novel transcripts from RNA-seq data. Nature Biotechnology, 33(3), 290-295. link ↗

Cara memetik halaman ini

ScholarGate. (2026, June 3). De Novo RNA-Seq Transcriptome Assembly. ScholarGate. https://scholargate.app/ms/bioinformatics/de-novo-transcriptome-assembly

Kaedah yang mana?

Letakkan kaedah ini di sebelah kaedah yang paling rapat dengannya dan baca secara bersebelahan — perpustakaan menyusun buku di atas meja; pilihan terletak pada anda.