Analīze CRISPR skrīningiem
Analīze CRISPR skrīningiem apstrādā datus no kopīgiem (pooled) ģenētiskiem skrīningiem, izmantojot CRISPR-Cas9, lai identificētu gēnus, kas nepieciešami šūnu augšanai, izdzīvošanai vai noteikta fenotipa parādīšanai specifiskos apstākļos. Šo aprēķinu (computational) cauruļvadu, ko izstrādājuši Zhang, Sanjana un citi, pārvērš gida RNS (guide RNA) daudzumu sekvenču nolasījumus sakārtotos funkcionālo gēnu sarakstos.
Lasīt pilno metodes aprakstu
Piesakieties ar bezmaksas kontu, lai lasītu šo sadaļu.
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
Avoti
- Shalem, O., Sanjana, N. E., Hartenian, E., Shi, X., Scott, D. A., Mikkelsen, T. S., ... & Zhang, F. (2014). Genome-scale CRISPR-Cas9 knockout screening in human cells. Science, 343(6166), 84-87. DOI: 10.1126/science.1247005 ↗
- Hart, T., Chandrashekhar, M., Aregger, M., Steinhart, Z., Brown, K. R., MacLeod, G., ... & Moffat, J. (2015). High-resolution CRISPR screens reveal fitness genes and pathways. Molecular Systems Biology, 11(8), 820. link ↗
- King, J. B., Palmer, A. C., & Sorger, P. K. (2020). Application of a genetic algorithm designed for flexible objective optimization in pharmaceutical research and development. Cancer Research, 79(13 Supplement), 3435. link ↗
Kā citēt šo lapu
ScholarGate. (2026, June 3). CRISPR Screening Data Analysis and Hit Identification. ScholarGate. https://scholargate.app/lv/bioinformatics/crispr-screen-analysis
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
- Transkriptoma montāža de novoBioinformātika↔ compare
- HMMER profila meklēšanaBioinformātika↔ compare
- Metagenomiskā iedalīšanaBioinformātika↔ compare
Uz to atsaucas
Pamanījāt kļūdu šajā lapā? Ziņojiet vai ierosiniet labojumu →