검사 유효성 검증 및 성능 평가

검사 유효성 검증 및 성능 평가는 분자 검사가 주장하는 바를 재현성 있게 측정하고, 의도된 임상적 용도를 지원함을 보여주는 일련의 작업입니다. 이는 분석적 유효성 검증(분석법이 분석물을 정확하게 측정하는가?)과 임상적 유효성 검증(결과가 임상 상태를 반영하는가?)을 구분하며, 정확도, 정밀도, 민감도, 특이도, 검출 한계와 같은 지표로 성능을 정량화합니다.

Definition

검사 유효성 검증은 체계적인 실험을 통해 실험실 검사가 정확하고 재현성 있게 수행되며 의도된 임상 목적에 적합함을 입증하는 문서화된 과정이며, 성능 평가는 이러한 특성들을 지속적으로 측정하고 확인하는 것입니다.

Scope

이 항목은 임상 사용 전 분자 검사 성능을 확립하고 문서화하며, 그 후 이를 확인하는 데 사용되는 개념과 지표를 다룹니다: 분석적 유효성과 임상적 유효성, 표준 성능 특성, 그리고 고난이도 분석법 및 그 생물정보학 파이프라인에 대한 특별 고려사항입니다. 이는 방법론적 주제이며, 환자 진단 또는 치료에 대한 지침을 제공하지 않습니다.

Core questions

• 분석적 유효성과 임상적 유효성의 차이점은 무엇입니까?
• 분자 검사에 대해 어떤 성능 특성을 확립해야 합니까?
• 검출 한계와 정량 한계는 어떻게 결정됩니까?
• 습식 실험실 분석법뿐만 아니라 염기서열 분석 및 생물정보학 파이프라인은 어떻게 유효성을 검증합니까?

Key concepts

• 분석적 유효성
• 임상적 유효성
• 정확도 및 참값
• 정밀도 (반복성 및 재현성)
• 분석적 민감도 및 검출 한계
• 분석적 특이도
• 보고 가능 및 측정 가능 범위
• 생물정보학 파이프라인 유효성 검증
• 의도된 용도에 대한 적합성

Mechanisms

유효성 검증은 특성화된 샘플을 사용하여 설계된 실험을 통해 진행됩니다. 정확도는 참조 방법 또는 알려진 검체와의 비교를 통해 평가됩니다. 정밀도는 반복성 및 재현성 조건에서 반복 측정을 통해 평가됩니다. 분석적 민감도는 검출 한계를 결정하여 평가되며, 분석적 특이도는 간섭 및 교차 반응성을 테스트하여 평가됩니다 (Jennings et al., 2009). 정량적 분자 분석법은 액적 디지털 PCR 액체 생검 분석법에서 보여진 바와 같이 (Milosevic et al., 2018), 다른 측정 대상물에 사용되는 것과 동일한 임상 화학 프레임워크로 유효성을 검증할 수 있습니다. 차세대 염기서열 분석의 경우, 변이를 호출하고 필터링하는 계산 파이프라인은 실험실 단계와 함께 유효성을 검증해야 합니다 (Roy et al., 2018). 이들과는 별개로 임상적 유효성은 결과가 임상 상태를 얼마나 잘 분류하는지 묻습니다.

Clinical relevance

분자 검사 결과가 환자 치료에 신뢰될 수 있는지 여부는 그 뒤에 있는 유효성 검증 및 성능 작업에 달려 있습니다. 문서화되지 않거나 약한 성능 특성은 해석을 저해할 수 있습니다. 이 항목은 실험실이 어떻게 그 신뢰를 확립하는지 설명하며, 특정 검사를 주문하거나 조치하는 지침이 아닙니다.

Evidence & guidelines

유효성 검증 관행은 분자 병리 검사 및 염기서열 분석 파이프라인 유효성 검증을 위한 AMP/CAP 원칙 (Jennings et al., 2009; Roy et al., 2018) 및 CLSI 합의 문서 (CLSI EP28)를 포함한 전문 지침에 명문화되어 있습니다. 이들은 실험실이 인증 하에 따르는 실험 설계 및 허용 기준을 제공합니다.

History

임상 분자 검사가 확대됨에 따라, 전문 기관들은 확립된 임상 화학 및 실험실 의학 유효성 검증 원칙을 분자 분석법에 적용한 다음, 이를 대규모 병렬 염기서열 분석 및 그 생물정보학으로 확장하여 오늘날 사용되는 계층화된 유효성 검증 표준을 만들었습니다 (Jennings et al., 2009; Roy et al., 2018).

Debates

고난이도 다중 표적 분석법에 대한 유효성 검증은 어떻게 확장되어야 합니까?

광범위한 염기서열 분석 패널로 검출 가능한 모든 가능한 변이에 대한 성능을 확립하는 것은 비실용적이므로, 지침은 대표적인 유효성 검증 및 파이프라인 유효성 검증에 의존합니다. 어느 정도가 충분한지에 대한 논의는 여전히 활발합니다.

Seminal works

• jennings-2009
• roy-2018

Frequently asked questions

분석적 유효성과 임상적 유효성의 차이점은 무엇입니까?

분석적 유효성은 분석법이 분석물을 정확하고 재현성 있게 측정하는지 여부이며, 임상적 유효성은 결과가 검사가 감지하려는 임상 상태와 실제로 일치하는지 여부입니다.

차세대 염기서열 분석에 파이프라인 유효성 검증이 필요한 이유는 무엇입니까?

보고되는 변이가 리드를 정렬하고 변이를 호출하는 소프트웨어에 의존하기 때문에, 생물정보학 파이프라인은 오류를 유발할 수 있으며 실험실 절차와 함께 유효성을 검증해야 합니다.