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단일 세포 계통 발생 분석 — 단일 세포 해상도에서의 계통수 재구성

단일 세포 계통 발생 분석은 단일 세포 염기서열 분석 데이터를 사용하여 진화적 또는 발달적 계통수를 재구성하며, 개별 세포가 공통 조상으로부터 어떻게 분기되었는지를 추적합니다. 체세포 돌연변이, CRISPR 도입 바코드 또는 복제수 변화를 유전 가능한 특징으로 활용함으로써, 이 방법은 종양, 발달 중인 조직 또는 면역 레퍼토리 내의 클론 관계를 전례 없는 세포 해상도로 매핑합니다.

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출처

  1. Jones, M. G., Khodaverdian, A., Quinn, J. J., Chan, M. M., Hussmann, J. A., Wang, R., Xu, C., Weissman, J. S., & Yosef, N. (2020). Inference of single-cell phylogenies from lineage tracing data using Cassiopeia. Genome Biology, 21(1), 92. DOI: 10.1186/s13059-020-02000-8
  2. Trapnell, C., Cacchiarelli, D., Grimsby, J., Pokharel, P., Li, S., Morse, M., Lennon, N. J., Livak, K. J., Mikkelsen, T. S., & Rinn, J. L. (2014). The dynamics and regulators of cell fate decisions are revealed by pseudotemporal ordering of single cells. Nature Biotechnology, 32(4), 381-386. DOI: 10.1038/nbt.2859

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ScholarGateSingle-cell Phylogenetic Analysis (Single-cell Phylogenetic and Lineage Tree Reconstruction). 2026-06-15에 다음에서 검색함: https://scholargate.app/ko/bioinformatics/single-cell-phylogenetic-analysis · 데이터셋: https://doi.org/10.5281/zenodo.20539026