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차등 단일 세포 RNA 시퀀싱 분석
차등 단일 세포 RNA 시퀀싱(scRNA-seq) 분석은 단일 세포 해상도에서 생물학적 조건(예: 처리군 대 미처리군, 질병군 대 건강군 또는 시간 경과에 따른 변화) 간의 전사체 프로파일을 비교하는 계산 파이프라인입니다. 이 분석은 어떤 유전자, 세포 유형 및 세포 상태가 조건 간에 변화하는지를 식별하여, 일반 RNA 시퀀싱 비교로는 얻을 수 없는 기전적 통찰력을 제공합니다. 이 접근법은 클러스터링, 세포 유형 주석 달기 및 통계적 검정을 결합하며, 일반적으로 샘플 내 상관관계를 고려하기 위해 유사 벌크(pseudobulk) 집계를 사용합니다.
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출처
- Hafemeister, C., & Satija, R. (2019). Normalization and variance stabilization of single-cell RNA-seq data using regularized negative binomial regression. Genome Biology, 20, 296. link ↗
- Squair, J. W., Gautier, M., Kathe, C., Anderson, M. A., James, N. D., Hutson, T. H., Lefoulon, E., Tani, N., Bhatt, D. L., Rossetti, A., & Courtine, G. (2021). Confronting false discoveries in single-cell differential expression. Nature Communications, 12, 5692. link ↗
이 페이지 인용 방법
ScholarGate. (2026, June 3). Differential Single-Cell RNA Sequencing Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/ko/bioinformatics/differential-single-cell-rna-seq-analysis
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