手法証拠記録
Metagenomic Binning
Metagenomic binning partitions assembled contigs from complex microbial communities into distinct genome bins, each representing an individual organism or strain. Pioneered by Banfield and colleagues, this pipeline isolates single-organism genomes (metagenome-assembled genomes or MAGs) from environmental samples without requiring cultivated isolates.
出典記録
引用は手法の出典記録からそのままコピーされています。それらからレベルごとの検証は推論されません。
Metagenome Assembly and Genome Binning
分類的手法記録 · process-pipeline / bioinformatics
- Kang, D. D., Froula, J., Egan, R., & Wang, Z. (2015). MetaBAT, an efficient tool for accurately reconstructing single genomes from complex microbial communities. PeerJ, 3, e1165. · DOI 10.7717/peerj.1165
- Jain, C., Rodriguez-R, L. M., Phillippy, A. M., Konstantinidis, K. T., & Aluru, S. (2018). High throughput ANI analysis of 90K prokaryotic genomes reveals clear species boundaries. Nature Communications, 9(1), 4045. · DOI 10.1038/s41467-018-07641-9
- Sieber, C. M. K., Probst, A. J., Sharrar, A., Thomas, B. C., Hess, M., Tringe, S. G., & Banfield, J. F. (2018). Recovery of genomes from metagenomes via a dereplication, aggregation and scoring strategy. Nature Microbiology, 3(7), 836-843. · DOI 10.1038/s41564-018-0171-1
キュレーションされた主張
主張は証拠台帳に永続化され、それぞれが独自の評価を持っています。
まだキュレーションされた主張はありません
このビューは、台帳に主張評価がない場合、主張評価を生成しません。
関連手法
手法グラフから生成され、機械が提案した関係として表示されます — 証拠主張は推論されません。