Bayesian Microbiome Diversity Analysis
Bayesian microbiome diversity analysis applies probabilistic models — chiefly Dirichlet-Multinomial and related hierarchical frameworks — to 16S rRNA or shotgun metagenomic count data to estimate alpha-diversity (within-sample richness and evenness) and beta-diversity (between-sample compositional differences) while propagating uncertainty through the entire inference chain. Unlike frequentist rarefaction-based approaches, Bayesian methods treat taxon counts as draws from a latent composition, enabling credible intervals on diversity metrics and principled comparison across groups with unequal sequencing depth.
出典記録
引用は手法の出典記録からそのままコピーされています。それらからレベルごとの検証は推論されません。
- Holmes, I., Harris, K., & Quince, C. (2012). Dirichlet Multinomial Mixtures: Generative Models for Microbial Metagenomics. PLOS ONE, 7(2), e30126. · URL
- La Rosa, P. S., Brooks, J. P., Deych, E., Boone, E. L., Edwards, D. J., Wang, Q., Sodergren, E., Weinstock, G., & Shannon, W. D. (2012). Hypothesis Testing and Power Calculations for Taxonomic-Based Human Microbiome Data. PLOS ONE, 7(12), e52078. · URL
キュレーションされた主張
主張は証拠台帳に永続化され、それぞれが独自の評価を持っています。
このビューは、台帳に主張評価がない場合、主張評価を生成しません。
関連手法
手法グラフから生成され、機械が提案した関係として表示されます — 証拠主張は推論されません。