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Network-based GWAS/Evidenza
Record di evidenza del metodo

Network-based GWAS

Network-based GWAS integrates conventional genome-wide association study results with biological network data — such as protein-protein interaction (PPI) networks or gene co-expression graphs — to identify disease-relevant gene modules or subnetworks. Instead of reporting only the top individual SNPs, this approach propagates association signals through molecular interaction networks, surfacing gene clusters whose collective signal implicates them in complex-trait biology even when no single variant reaches genome-wide significance alone.

Sources recorded, not reviewed

Record di origine

Citazioni copiate testualmente dal record di origine del metodo. Non si inferisce alcuna verifica a livello di affermazione da esse.

Network-based Genome-Wide Association Study
Record tassonomico del metodo · process-pipeline / bioinformatics
  • Wang, Q., Yu, H., Zhao, Z., & Jia, P. (2015). EW_dmGWAS: edge-weighted dense module search for genome-wide association studies and gene expression profiles. Bioinformatics, 31(15), 2591–2594. · URL
  • Leiserson, M. D. M., Vandin, F., Wu, H.-T., Dobson, J. R., Eldridge, J. V., Thomas, J. L., Papoutsaki, A., Kim, Y., Niu, B., McLellan, M., Lawrence, M. S., Gonzalez-Perez, A., Tamborero, D., Cheng, Y., Ryslik, G. A., Lopez-Bigas, N., Getz, G., Ding, L., & Raphael, B. J. (2015). Pan-cancer network analysis identifies combinations of rare somatic mutations contributing to tumorigenesis. Nature Genetics, 47(2), 106–114. · URL
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Affermazioni curate

Affermazioni persistite nel registro delle evidenze, ciascuna con la propria valutazione.

Nessuna affermazione curata ancora

Questa vista non inventa una valutazione dell'affermazione quando il registro non ne ha.

Metodi correlati

Generato dal grafo dei metodi e mostrato come relazioni suggerite dalla macchina — nessuna affermazione di evidenza viene inferita.

Taxonomic bucketCopy Number Variation Analysismachine-suggested · Relational suggestion, not evidence.Taxonomic bucketeQTL Analysismachine-suggested · Relational suggestion, not evidence.Taxonomic bucketGene Set Enrichment Analysismachine-suggested · Relational suggestion, not evidence.Taxonomic bucketGenome-wide association studymachine-suggested · Relational suggestion, not evidence.Taxonomic bucketNetwork-based eQTL analysismachine-suggested · Relational suggestion, not evidence.Taxonomic bucketPathway Enrichment Analysismachine-suggested · Relational suggestion, not evidence.

Stato evidenza

Sources recorded, not reviewed

Bibliographic sources are present. Claim-level evidence review has not been performed.

Fonti

2 citazioni registrate, copiate dal record di origine del metodo.

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