Analisi filogenetica Bayesiana — Inferenza di alberi evolutivi basata su MCMC

L'analisi filogenetica Bayesiana utilizza il teorema di Bayes e il campionamento Markov chain Monte Carlo (MCMC) per stimare la distribuzione di probabilità a posteriori su alberi filogenetici e parametri del modello, dati i dati di sequenza osservati. A differenza dei metodi di massima verosimiglianza con bootstrap, che restituiscono un singolo albero migliore, l'inferenza Bayesiana produce un insieme credibile di alberi con probabilità a posteriori associate, fornendo una misura principiale dell'incertezza filogenetica. È il quadro dominante per la stima dei tempi di divergenza e delle relazioni ancestrali nell'evoluzione molecolare.