Interval Serial dan Waktu Generasi

Waktu generasi adalah interval antara infeksi kasus primer dan infeksi kasus sekunder yang ditimbulkannya, sedangkan interval serial adalah interval antara timbulnya gejala pada kasus primer dan pada kasus sekundernya. Karena waktu infeksi biasanya tidak teramati, interval serial adalah apa yang dapat diukur oleh surveilans dan digunakan sebagai proksi praktis untuk waktu generasi; kedua kuantitas ini menghubungkan waktu penularan dengan estimasi seberapa cepat suatu penyakit menyebar.

Definition

Waktu generasi adalah waktu antara infeksi suatu kasus dan infeksi orang yang diinfeksinya; interval serial adalah waktu antara timbulnya gejala pada suatu kasus dan timbulnya gejala pada orang yang diinfeksinya, digunakan sebagai proksi yang dapat diamati untuk waktu generasi.

Scope

Entri ini membedakan waktu generasi dari interval serial, menjelaskan bagaimana masing-masing berhubungan dengan periode inkubasi dan infeksius, serta menjelaskan bagaimana ukuran waktu ini menghubungkan tingkat pertumbuhan epidemi dengan angka reproduksi. Ini adalah topik referensi metodologis, bukan panduan klinis.

Core questions

• Bagaimana waktu generasi dan interval serial berbeda, dan mengapa perbedaan itu penting?
• Bagaimana interval ini berhubungan dengan periode inkubasi dan periode infeksius?
• Bagaimana distribusi interval serial digunakan untuk memperkirakan angka reproduksi?
• Mengapa waktu generasi biasanya diperkirakan daripada diamati secara langsung?

Key concepts

• Waktu generasi (interval generasi)
• Interval serial
• Periode inkubasi
• Periode laten dan infeksius
• Distribusi interval serial
• Tingkat pertumbuhan epidemi
• Estimasi angka reproduksi dari waktu

Key theories

Interval generasi dan hubungan tingkat pertumbuhan-ke-R

Wallinga dan Lipsitch menunjukkan bahwa bentuk distribusi interval generasi menentukan bagaimana tingkat pertumbuhan epidemi yang diamati diterjemahkan menjadi angka reproduksi, sehingga ukuran waktu sangat penting untuk menafsirkan penularan.

Mechanisms

Waktu penularan dibangun dari riwayat alamiah infeksi: setelah infeksi ada periode laten sebelum inang menjadi infeksius dan periode inkubasi sebelum gejala muncul, dan inang menularkan selama periode infeksiusnya. Waktu generasi mengukur infeksi-ke-infeksi, sedangkan interval serial mengukur onset-ke-onset; keduanya bertepatan secara rata-rata di bawah beberapa asumsi tetapi berbeda dalam varians. Karena waktu infeksi jarang diamati, analis menggunakan distribusi interval serial, bersama dengan tingkat pertumbuhan epidemi, untuk memperkirakan angka reproduksi, termasuk metode yang memulihkan probabilitas siapa-menginfeksi-siapa atau angka reproduksi yang bervariasi waktu dari data onset kasus.

Clinical relevance

Ukuran waktu memungkinkan analis mengubah kurva kasus yang diamati menjadi estimasi penularan dan menilai seberapa cepat wabah berkembang. Ini adalah kuantitas referensi yang menggambarkan proses penularan dan pembentukan estimasi epidemiologi, bukan dasar untuk keputusan diagnostik atau pengobatan individu.

Epidemiology

Interval serial dan waktu generasi yang diperkirakan bervariasi menurut patogen dan dipengaruhi oleh tindakan pengendalian yang memperpendek periode infeksius; tinjauan periode inkubasi untuk virus pernapasan mengilustrasikan bagaimana waktu riwayat alamiah berbeda antar agen, dan analisis SARS menggunakan data onset untuk memperkirakan penularan. Oleh karena itu, interval yang dilaporkan bersifat spesifik patogen dan pengaturan.

History

Gagasan tentang interval antara kasus-kasus berturut-turut telah lama ada dalam epidemiologi dan diklarifikasi oleh penjelasan Fine yang membedakan interval serial dari waktu penularan yang mendasarinya. Pada tahun 2000-an, penelitian oleh Wallinga dan rekan-rekannya memformalkan peran interval generasi dalam menghubungkan tingkat pertumbuhan dengan angka reproduksi dan mengembangkan metode estimasi praktis menggunakan data onset, dengan kerangka kerja berbasis perangkat lunak kemudian untuk angka reproduksi yang bervariasi waktu.

Debates

Dapatkah interval serial dengan aman menggantikan waktu generasi?

Interval serial dapat diamati tetapi dapat berbeda dari interval generasi dalam varians dan bahkan dapat negatif ketika penularan pra-gejala terjadi, sehingga menggunakannya sebagai proksi dapat membiaskan estimasi angka reproduksi kecuali jika perbedaannya diperhitungkan.

Key figures

• Jacco Wallinga
• Marc Lipsitch
• Paul Fine
• Anne Cori
• Justin Lessler

Seminal works

• wallinga-lipsitch-2007
• wallinga-teunis-2004
• fine-2003

Frequently asked questions

Apa perbedaan antara interval serial dan waktu generasi?

Waktu generasi diukur antara peristiwa infeksi, sedangkan interval serial diukur antara waktu timbulnya gejala; interval serial dapat diamati dan digunakan sebagai proksi karena waktu infeksi biasanya tidak diketahui.

Mengapa interval ini digunakan untuk memperkirakan angka reproduksi?

Distribusi waktu antara infeksi berturut-turut menghubungkan tingkat pertumbuhan epidemi yang diamati dengan jumlah kasus sekunder per kasus, sehingga diperlukan untuk menerjemahkan seberapa cepat kasus meningkat menjadi angka reproduksi.