Temuan Sekunder dan Insidental

Temuan sekunder dan insidental adalah hasil genetik yang berada di luar alasan asli pengujian. Temuan insidental ditemukan secara tidak terduga, sedangkan temuan sekunder dicari secara aktif dalam seperangkat gen yang ditentukan terlepas dari indikasi utama pengujian. Keduanya menimbulkan pertanyaan tentang hasil apa yang harus dicari dan dikembalikan ketika pengurutan luas secara tak terhindarkan mengungkapkan lebih dari yang diminta.

Definition

Temuan sekunder adalah hasil dalam seperangkat gen yang telah ditentukan sebelumnya yang dianalisis dan dilaporkan secara sengaja terlepas dari indikasi pengujian, sedangkan temuan insidental adalah hasil yang relevan secara klinis yang ditemukan secara tidak terduga selama analisis yang ditujukan untuk pertanyaan lain.

Scope

Topik ini membedakan temuan insidental dari temuan sekunder, menjelaskan dasar pemikiran untuk mempertahankan daftar gen yang terdefinisi dan diperbarui secara berkala yang dipertimbangkan untuk analisis sekunder yang disengaja, dan menguraikan kriteria, seperti kemampuan tindakan (actionability), yang digunakan untuk memutuskan gen mana yang termasuk dalam daftar tersebut. Ini membahas struktur interpretatif dan kebijakan seputar hasil yang tidak dicari, bukan keputusan klinis individu tentang pengembaliannya.

Core questions

• Bagaimana temuan sekunder berbeda dari temuan insidental?
• Mengapa mempertahankan daftar gen yang terdefinisi untuk analisis sekunder yang disengaja?
• Kriteria apa, seperti kemampuan tindakan (actionability), yang memutuskan gen mana yang termasuk?
• Bagaimana daftar tersebut berubah seiring berkembangnya bukti?

Key concepts

• Temuan insidental versus sekunder
• Daftar gen temuan sekunder yang terdefinisi
• Kemampuan tindakan klinis (Clinical actionability)
• Pilihan untuk menolak (Opt-out) dan pilihan pasien
• Revisi daftar berkala
• Ruang lingkup pelaporan dalam pengurutan luas

Mechanisms

Ketika pengurutan eksom atau genom dilakukan untuk satu indikasi, data secara tak terhindarkan mengandung informasi tentang banyak gen lain. Untuk menanganinya secara sistematis, rekomendasi profesional mendefinisikan daftar gen minimum di mana varian patogen yang diketahui harus dicari dan dilaporkan secara sengaja sebagai temuan sekunder, dipilih sebagian besar karena kondisi terkait dianggap dapat ditindaklanjuti secara medis (Green et al., 2013). Daftar ini tidak tetap: telah direvisi dan diperluas di seluruh versi berturut-turut seiring perubahan bukti dan konsensus (Miller et al., 2021; Miller et al., 2023). Temuan insidental, sebaliknya, tidak ditentukan sebelumnya tetapi muncul secara tak terduga dalam perjalanan analisis primer.

Clinical relevance

Penanganan hasil yang tidak dicari adalah masalah interpretatif dan konseling sentral dalam pengujian genomik luas, termasuk bagaimana ruang lingkup pelaporan didefinisikan dan bagaimana pilihan pasien dihormati. Topik ini menjelaskan kerangka kerja dan kriteria untuk temuan sekunder dan insidental; ini adalah laporan referensi dan tidak mengarahkan apakah atau bagaimana mengembalikan temuan tertentu kepada individu.

Epidemiology

Karena temuan sekunder dicari dalam seperangkat gen yang ditentukan, proporsi individu dengan temuan sekunder yang dapat dilaporkan bergantung pada gen yang termasuk dan populasi yang diuji; perluasan daftar di seluruh versi mengubah hasil yang diharapkan (Miller et al., 2021; Miller et al., 2023).

History

Seiring dengan pertumbuhan pengurutan eksom dan genom klinis, pertanyaan tentang hasil yang tidak dicari menjadi tak terhindarkan, dan pernyataan kebijakan tahun 2013 memperkenalkan daftar gen minimum yang ditentukan untuk diperiksa guna mencari temuan sekunder yang dapat dilaporkan, dipilih berdasarkan kemampuan tindakan (actionability) (Green et al., 2013). Daftar tersebut sejak itu telah dipertahankan dan diperbarui secara berkala melalui versi-versi berturut-turut, mencerminkan akumulasi bukti dan pergeseran konsensus tentang gen mana yang layak untuk dimasukkan (Miller et al., 2021; Miller et al., 2023).

Debates

Gen mana yang harus ada dalam daftar temuan sekunder, dan haruskah pasien dapat menolaknya?

Memutuskan gen mana yang memenuhi standar kemampuan tindakan (actionability) untuk pelaporan yang disengaja, dan bagaimana menghormati preferensi pasien untuk menolak, telah diperdebatkan sejak daftar tersebut diperkenalkan dan telah membentuk revisi-revisi berikutnya.

Key figures

• Robert C. Green
• David T. Miller
• Leslie Biesecker

Seminal works

• green-2013
• miller-2021
• miller-2023

Frequently asked questions

Apa perbedaan antara temuan sekunder dan temuan insidental?

Temuan sekunder secara sengaja dicari dalam seperangkat gen yang telah ditentukan sebelumnya terlepas dari alasan mengapa pengujian diperintahkan, sedangkan temuan insidental adalah temuan yang ditemukan secara tidak terduga saat menganalisis pertanyaan asli.

Mengapa ada daftar gen yang terdefinisi untuk temuan sekunder?

Pengurutan luas mengungkapkan jauh lebih banyak daripada pertanyaan asli, sehingga daftar yang terdefinisi, yang dipilih sebagian besar karena kemampuan tindakan medis (medical actionability), memberikan ruang lingkup yang konsisten dan berbasis bukti untuk hasil tambahan mana yang secara sengaja diperiksa dan dilaporkan.