Deteksi Fenotip Pola Resistansi Umum

Deteksi fenotip pola resistansi menggunakan uji berbasis pertumbuhan dan biokimia untuk mengenali mekanisme resistansi spesifik yang penting secara klinis yang diekspresikan oleh suatu organisme, di luar sekadar mengkategorikannya sebagai rentan atau resistan. Contoh klasik meliputi deteksi beta-laktamase spektrum luas (ESBL), karbapenemase, dan resistansi metisilin pada stafilokokus.

Definition

Deteksi resistansi fenotip adalah penggunaan uji berbasis pertumbuhan, sinergi, atau biokimia untuk menunjukkan bahwa suatu organisme mengekspresikan mekanisme resistansi tertentu, seperti produksi beta-laktamase atau karbapenemase spesifik, membedakan mekanisme tersebut daripada hanya kategori kerentanannya.

Scope

Entri ini mencakup strategi fenotip utama untuk mengonfirmasi pola resistansi umum: uji kombinasi-cakram dan sinergi dwi-cakram untuk ESBL, uji karbapenemase biokimia dan berbasis pertumbuhan seperti Carba NP dan metode inaktivasi karbapenem, serta skrining berbasis sefoksitin untuk resistansi metisilin. Entri ini menjelaskan apa yang ditunjukkan oleh uji-uji ini dan batasannya, serta merupakan materi referensi daripada panduan pengobatan.

Core questions

• Apakah organisme ini mengekspresikan mekanisme resistansi spesifik seperti ESBL atau karbapenemase?
• Uji fenotip apa yang dapat mengonfirmasi mekanisme tersebut, dan apa arti hasilnya?
• Apa keterbatasan deteksi fenotip dibandingkan dengan konfirmasi molekuler?

Key concepts

• Deteksi beta-laktamase spektrum luas (ESBL)
• Uji sinergi dwi-cakram dan kombinasi-cakram
• Deteksi karbapenemase (Carba NP, metode inaktivasi karbapenem)
• Skrining sefoksitin untuk resistansi metisilin
• Resistansi klindamisin yang dapat diinduksi (uji D)
• Uji konfirmasi versus skrining
• Ketidaksesuaian fenotip-genotip

Mechanisms

Uji fenotip mengungkapkan mekanisme resistansi melalui efek fungsionalnya. Deteksi ESBL bergantung pada pemulihan kerentanan terhadap sefalosporin indikator ketika penghambat beta-laktamase (seperti asam klavulanat) ditambahkan, terlihat sebagai sinergi dalam format dwi-cakram atau kombinasi-cakram (paterson-2005). Aktivitas karbapenemase dapat dideteksi secara biokimia melalui hidrolisis karbapenem, seperti pada uji kolorimetri Carba NP, atau melalui uji berbasis pertumbuhan seperti metode inaktivasi karbapenem, di mana cakram karbapenem yang terpapar organisme uji kehilangan kemampuannya untuk menghambat galur indikator yang rentan (van-der-zwaluw-2015; nordmann-2009). Resistansi metisilin pada stafilokokus diskrining secara fenotip menggunakan sefoksitin, pengganti yang lebih baik dalam menginduksi dan mendeteksi resistansi yang dimediasi mecA, dan resistansi makrolida-linkosamida yang dapat diinduksi ditunjukkan oleh uji D. Aturan ahli membantu menafsirkan pola-pola ini dan menandai hasil yang tidak konsisten (leclercq-2013; clsi-m100).

Clinical relevance

Mengenali fenotip resistansi seperti produksi ESBL atau karbapenemase sangat penting untuk pengendalian infeksi, surveilans, dan penatalaksanaan, karena mekanisme ini memengaruhi seluruh kelas agen. Entri ini menjelaskan bagaimana fenotip tersebut ditunjukkan di laboratorium sebagai pengetahuan referensi dan tidak memberikan panduan diagnostik atau peresepan individual.

Epidemiology

Enterobacterales penghasil karbapenemase dan produsen ESBL telah menyebar secara internasional, menjadikan deteksi fenotipnya sebagai prioritas bagi laboratorium dan jaringan surveilans; epidemiologi mekanisme ini telah membentuk pengembangan dan adopsi uji konfirmasi (nordmann-2009; paterson-2005).

History

Seiring dengan diversifikasi mekanisme resistansi beta-laktam sejak tahun 1980-an, laboratorium mengembangkan uji konfirmasi fenotip, dimulai dengan deteksi ESBL berbasis penghambat. Munculnya organisme penghasil karbapenemase secara internasional pada tahun 2000-an mendorong uji karbapenemase biokimia dan berbasis pertumbuhan yang cepat seperti uji Carba NP dan, kemudian, metode inaktivasi karbapenem yang lebih sederhana (paterson-2005; nordmann-2009; van-der-zwaluw-2015).

Debates

Konfirmasi fenotip versus molekuler

Uji fenotip mendeteksi aktivitas fungsional tetapi mungkin tidak mengidentifikasi gen spesifik, sementara uji molekuler mengidentifikasi gen yang tidak selalu diekspresikan; kombinasi dan urutan metode yang tepat untuk mengonfirmasi mekanisme seperti produksi karbapenemase masih diperdebatkan.

Sensitivitas untuk mekanisme yang diekspresikan secara lemah

Beberapa mekanisme resistansi diekspresikan pada tingkat rendah atau hanya di bawah induksi, sehingga skrining fenotip dapat melewatkannya, menimbulkan pertanyaan tentang strategi konfirmasi mana yang memberikan sensitivitas yang memadai.

Seminal works

• paterson-2005
• nordmann-2009
• van-der-zwaluw-2015

Frequently asked questions

Apa yang ditunjukkan oleh uji konfirmasi ESBL?

Ini menunjukkan bahwa penambahan penghambat beta-laktamase mengembalikan kerentanan organisme terhadap sefalosporin indikator, menunjukkan produksi beta-laktamase spektrum luas; ini menunjukkan mekanisme fungsional daripada menamai enzim spesifik.

Mengapa mendeteksi karbapenemase secara fenotip ketika ada uji molekuler?

Uji fenotip seperti metode inaktivasi karbapenem tidak mahal dan mendeteksi aktivitas hidrolisis karbapenem fungsional terlepas dari gen spesifiknya, melengkapi uji molekuler yang menargetkan gen yang diketahui tetapi mungkin melewatkan gen baru.