कवक वर्गीकरण और पहचान

कवक वर्गीकरण और पहचान माइकोलॉजी की वह शाखा है जो इस बात से संबंधित है कि कवकों को एक सुसंगत विकासवादी पदानुक्रम में कैसे वर्गीकृत किया जाता है और व्यक्तिगत आइसोलेट्स को कैसे पहचाना और नामित किया जाता है। इसमें कवक जगत का उच्च-स्तरीय विभाजन जैसे एस्कोमाइकोटा (Ascomycota) और बेसिडियोमाइकोटा (Basidiomycota) में, टैक्सोन को अलग करने के लिए उपयोग की जाने वाली रूपात्मक और आणविक विशेषताएं, और व्यावहारिक कार्यप्रवाह शामिल हैं जिनके द्वारा एक नैदानिक या पर्यावरणीय कवक की पहचान की जाती है।

Definition

कवक वर्गीकरण एक विकासवादी ढांचे के भीतर कवकों का व्यवस्थित वर्गीकरण और नामकरण है, जबकि कवक पहचान रूपात्मक, जैव रासायनिक और आणविक विशेषताओं का उपयोग करके एक अज्ञात आइसोलेट को ज्ञात टैक्सोन को सौंपने की प्रक्रिया है।

Scope

यह क्षेत्र पाठक को कवक जगत के आधुनिक वर्गीकरण और जीनस तथा प्रजाति स्तर पर कवकों की पहचान करने के लिए उपयोग की जाने वाली विधियों से परिचित कराता है। यह तीन विषयों का परिचय देता है: दो सबसे बड़े विभाजन (एस्कोमाइकोटा और बेसिडियोमाइकोटा), जाइगोमाइसेट कवक और अन्य विभाजन, और रूपात्मक तथा आणविक पहचान विधियाँ जो वर्गीकरण और नैदानिक माइकोलॉजी दोनों को रेखांकित करती हैं। यह एक संदर्भ अवलोकन है, न कि नैदानिक या उपचार प्रोटोकॉल।

Sub-topics

• एस्कोमाइसिटीज़ और बेसिडियोमाइसिटीज़
• कवक आकृति विज्ञान और पहचान के तरीके
• ज़ाइगोमाइसिटीज़ और अन्य कवकीय प्रभाग

Core questions

• कवक जगत को फाइला में कैसे विभाजित किया जाता है और आणविक फाइलोजेनेटिक्स ने उस विभाजन को कैसे नया रूप दिया है?
• कौन सी रूपात्मक और प्रजनन संरचनाएं प्रमुख कवक समूहों को अलग करती हैं?
• नैदानिक और पर्यावरणीय कवकों की पहचान कैसे की जाती है, और रूपाकृति विज्ञान, अनुक्रमण और मास स्पेक्ट्रोमेट्री प्रत्येक कहाँ लागू होते हैं?
• पुराने समूहों जैसे 'जाइगोमाइसेट्स' और फॉर्म-ग्रुप 'फंगी इम्परफेक्टी' को क्यों संशोधित किया गया है?

Key concepts

• कवक जगत और उसके फाइला
• एस्कोमाइकोटा और बेसिडियोमाइकोटा
• जाइगोमाइसेट कवक (म्यूकोरोमाइकोटा और संबद्ध वंशावली)
• रूपात्मक पहचान (हाइफा, बीजाणु, फलने वाली संरचनाएं)
• डीएनए बारकोडिंग और आईटीएस क्षेत्र
• आणविक फाइलोजेनेटिक्स
• टेलीमोर्फ, एनामोर्फ, और एक कवक, एक नाम की ओर बढ़ना
• माल्डी-टीओएफ मास स्पेक्ट्रोमेट्री पहचान

Mechanisms

वर्गीकरण अनुमानित विकासवादी संबंधों पर आधारित है: साझा वंशावली को रूपात्मक विशेषताओं (उदाहरण के लिए यौन फलने वाले शरीर का प्रकार) और, तेजी से, डीएनए अनुक्रम डेटा से पुनर्निर्मित किया जाता है, ताकि नामित समूह जहाँ संभव हो, मोनोफिलेटिक वंशावली के अनुरूप हों। हिब्बेट और सहयोगियों (2007) ने जगत के उच्च-स्तरीय वर्गीकरण में आणविक और रूपात्मक साक्ष्य को संश्लेषित किया, और आंतरिक ट्रांसक्राइब्ड स्पेसर (ITS) क्षेत्र को कवकों के लिए एक सार्वभौमिक डीएनए बारकोड के रूप में अपनाया गया (शॉच एट अल., 2012), जिससे पहचान को एक अनुक्रम-आधारित सामान्य मुद्रा मिली जो पारंपरिक माइक्रोस्कोपी और कल्चर का पूरक है।

Clinical relevance

सटीक पहचान नैदानिक माइकोलॉजी का आधार है क्योंकि एक कवक का जीनस और प्रजाति अपेक्षित व्यवहार और प्रयोगशाला प्रबंधन को सूचित करता है, और हिस्टोपैथोलॉजी ऊतक में कवक तत्वों को पहचानने के लिए एक मुख्य उपकरण बनी हुई है (गुआरनर और ब्रांड्ट, 2011)। यह क्षेत्र बताता है कि कवकों का नामकरण और पहचान कैसे की जाती है और यह ज्ञान प्रयोगशाला निदान का समर्थन कैसे करता है; यह व्यक्तिगत नैदानिक या चिकित्सीय निर्देशों का स्रोत नहीं है।

Evidence & guidelines

इस क्षेत्र के लिए संदर्भ ढांचा हिब्बेट एट अल. (2007) और डीप हाइफा संश्लेषण (ब्लैकवेल एट अल., 2006) द्वारा समेकित कवक जगत का आणविक-फाइलोजेनेटिक वर्गीकरण है, साथ ही आईटीएस बारकोडिंग मानक (शॉच एट अल., 2012) भी है। नैदानिक पहचान अतिरिक्त रूप से हिस्टोपैथोलॉजिक और प्रयोगशाला समीक्षाओं जैसे गुआरनर और ब्रांड्ट (2011) पर आधारित है।

History

प्रारंभिक कवक वर्गीकरण दृश्यमान प्रजनन संरचनाओं पर आधारित था, कवकों को उनके यौन बीजाणुओं के उत्पादन के तरीके से विभाजित करता था और अलैंगिक रूपों को तथाकथित फंगी इम्परफेक्टी (Fungi imperfecti) के रूप में अलग से समूहित करता था। बीसवीं शताब्दी के अंत से, डीएनए अनुक्रमण ने विकासवादी संबंधों का सीधे परीक्षण करने की अनुमति दी; डीप हाइफा पहल (ब्लैकवेल एट अल., 2006) और हिब्बेट एट अल. (2007) का उच्च-स्तरीय वर्गीकरण ने जगत को फाइलोजेनेटिक लाइनों के साथ पुनर्गठित किया, और आईटीएस बारकोडिंग (शॉच एट अल., 2012) ने आणविक पहचान को मानकीकृत किया।

Key figures

• David Hibbett
• Meredith Blackwell
• John W. Taylor
• Conrad Schoch

Seminal works

• hibbett-2007
• schoch-2012
• blackwell-2006

Frequently asked questions

कवक जगत के प्रमुख विभाजन क्या हैं?

दो सबसे बड़े एस्कोमाइकोटा (थैली कवक) और बेसिडियोमाइकोटा (क्लब कवक) हैं; अतिरिक्त वंशावली में जाइगोमाइसेट कवक शामिल हैं जिन्हें अब म्यूकोरोमाइकोटा और संबद्ध फाइला में रखा गया है, साथ ही चिट्रिडियोमाइकोटा (Chytridiomycota) जैसे प्रारंभिक-विभिन्न समूह भी शामिल हैं।

प्रयोगशाला में कवकों की पहचान कैसे की जाती है?

पहचान में माइक्रोस्कोप के तहत रूपाकृति विज्ञान, कल्चर विशेषताएँ, और आईटीएस अनुक्रमण जैसी आणविक विधियाँ शामिल हैं, जिसमें तेजी से पहचान के लिए मास स्पेक्ट्रोमेट्री का उपयोग किया जा रहा है; उपयुक्त संयोजन जीव और सेटिंग पर निर्भर करता है।