बैक्टीरिया की पहचान के तरीके

बैक्टीरिया की पहचान के तरीके प्रयोगशाला में प्राप्त जीव की प्रजाति (और कभी-कभी स्ट्रेन) का निर्धारण करते हैं। ये शास्त्रीय सूक्ष्मदर्शी और जैव रासायनिक परीक्षण से लेकर मास-स्पेक्ट्रोमेट्री-आधारित प्रोटीओमिक प्रोफाइलिंग तक होते हैं, और चुनी गई विधि यह निर्धारित करती है कि किसी रोगज़नक़ का नाम कितनी जल्दी और सटीक रूप से रखा जा सकता है।

Definition

बैक्टीरिया की पहचान के तरीके वे प्रयोगशाला तकनीकें हैं जिनका उपयोग फेनोटाइपिक विशेषताओं, जैव रासायनिक प्रतिक्रियाओं, प्रोटीओमिक प्रोफाइल या आणविक लक्ष्यों का उपयोग करके प्राप्त आइसोलेट को एक टैक्सोन को सौंपने के लिए किया जाता है।

Scope

इस विषय में ग्राम अभिरंजन, कॉलोनी आकृति विज्ञान और जैव रासायनिक प्रतिक्रियाओं जैसे फेनोटाइपिक दृष्टिकोण शामिल हैं; स्वचालित पहचान प्रणालियाँ; और मैट्रिक्स-असिस्टेड लेजर डिसॉर्प्शन आयनाइजेशन टाइम-ऑफ-फ्लाइट (MALDI-TOF) मास स्पेक्ट्रोमेट्री। महामारी विज्ञान के उद्देश्यों के लिए स्ट्रेन-स्तर की टाइपिंग को संबंधित के रूप में नोट किया गया है। यह प्रविष्टि कार्यप्रणाली संबंधी है और इसमें व्यक्तिगत रोगियों के लिए नैदानिक निर्देश नहीं दिए गए हैं।

Core questions

• शास्त्रीय फेनोटाइपिक तरीके बैक्टीरिया की पहचान कैसे करते हैं?
• MALDI-TOF मास स्पेक्ट्रोमेट्री जीवों की पहचान कैसे करती है, और इसकी सीमाएं क्या हैं?
• फेनोटाइपिक तरीकों के बजाय, या उनके साथ, आणविक लक्ष्यों का उपयोग कब किया जाता है?

Key concepts

• ग्राम अभिरंजन और सूक्ष्मदर्शी
• कॉलोनी आकृति विज्ञान
• जैव रासायनिक और चयापचय प्रोफाइलिंग
• स्वचालित पहचान प्रणालियाँ
• MALDI-TOF मास स्पेक्ट्रोमेट्री
• प्रोटीन स्पेक्ट्रल डेटाबेस
• स्ट्रेन टाइपिंग

Mechanisms

फेनोटाइपिक पहचान अवलोकन योग्य गुणों को पढ़ती है: ग्राम-अभिरंजन प्रतिक्रिया और सूक्ष्मदर्शी आकृति विज्ञान संभावनाओं को कम करते हैं, कॉलोनी की उपस्थिति सुराग जोड़ती है, और जैव रासायनिक प्रतिक्रियाओं के पैनल उनकी चयापचय क्षमताओं द्वारा प्रजातियों को अलग करते हैं, अक्सर थ्रूपुट के लिए स्वचालित होते हैं। MALDI-TOF मास स्पेक्ट्रोमेट्री इसके बजाय एक कॉलोनी से एक प्रोटीन मास स्पेक्ट्रम, अनिवार्य रूप से एक प्रोटीओमिक फिंगरप्रिंट उत्पन्न करता है, और इसे एक संदर्भ डेटाबेस के खिलाफ मिलाता है, एक आइसोलेट उपलब्ध होने के बाद मिनटों के भीतर प्रजाति-स्तर की पहचान देता है; इसके अपनाने से नियमित प्रयोगशालाओं में पहचान के समय में काफी कमी आई (Seng 2009; Clark 2013)। जहां फेनोटाइप या स्पेक्ट्रा अस्पष्ट होते हैं, आणविक लक्ष्य पहचान को हल कर सकते हैं। प्रत्येक विधि की सीमाएं होती हैं, जिसमें डेटाबेस कवरेज और कुछ निकट संबंधी प्रजातियों को अलग करने में असमर्थता शामिल है (Clark 2013)।

Clinical relevance

तेज़, अधिक सटीक पहचान यह बताती है कि संक्रमणों को जीवों के लिए कैसे जिम्मेदार ठहराया जाता है और निगरानी कैसे की जाती है। किसी विधि की सीमाओं को जानने से यह पता चलता है कि कुछ निकट संबंधी प्रजातियों की रिपोर्ट केवल समूह स्तर पर क्यों की जाती है, या किसी असामान्य जीव को पुष्टिकरण परीक्षण की आवश्यकता क्यों हो सकती है। यह विषय बताता है कि प्रयोगशाला परिणाम कैसे उत्पन्न होते हैं और यह व्यक्तिगत निदान या उपचार निर्णयों का आधार नहीं है।

Evidence & guidelines

तुलनात्मक अध्ययन और समीक्षाएं नियमित बैक्टीरिया की पहचान और इसकी सीमाओं के लिए MALDI-TOF मास स्पेक्ट्रोमेट्री की सटीकता और टर्नअराउंड लाभों का दस्तावेजीकरण करती हैं (Seng 2009; Clark 2013), जबकि मानक ग्रंथ फेनोटाइपिक और जैव रासायनिक पहचान योजनाओं का वर्णन करते हैं (Jorgensen 2015)।

History

पहचान लंबे समय से बीसवीं शताब्दी में विकसित अभिरंजन, सूक्ष्मदर्शी और जैव रासायनिक पैनलों पर निर्भर थी। 2009 के आसपास MALDI-TOF मास स्पेक्ट्रोमेट्री की नैदानिक शुरुआत ने नियमित प्रयोगशालाओं में तेजी से प्रोटीओमिक पहचान की ओर एक बदलाव को चिह्नित किया, जो आणविक तरीकों का पूरक था (Seng 2009; Clark 2013)।

Seminal works

• seng-2009
• clark-2013

Frequently asked questions

MALDI-TOF मास स्पेक्ट्रोमेट्री बैक्टीरिया की पहचान कैसे करती है?

यह एक बैक्टीरियल कॉलोनी से एक विशिष्ट प्रोटीन मास स्पेक्ट्रम उत्पन्न करता है और एक संदर्भ डेटाबेस के खिलाफ इसकी तुलना करता है, एक आइसोलेट उपलब्ध होने के बाद मिनटों के भीतर एक प्रजाति-स्तर की पहचान प्रदान करता है।

क्या जैव रासायनिक परीक्षण अभी भी उपयोग किए जाते हैं?

हाँ; फेनोटाइपिक और जैव रासायनिक तरीके अभी भी उपयोगी हैं, खासकर जहां मास-स्पेक्ट्रोमेट्री डेटाबेस अधूरे हैं या जहां जीवों को प्रजाति की पहचान से परे चित्रित किया जाना चाहिए।