سیستماتیک تبارزایی
سیستماتیک تبارزایی روابط دودمانی بین موجودات زنده را بازسازی میکند و از این روابط به عنوان مبنایی برای طبقهبندی استفاده مینماید.
Definition
سیستماتیک تبارزایی عبارت است از استنتاج روابط تکاملی، که به صورت درختان شاخهدار نمایش داده میشوند، از توزیع صفات مشتقشده مشترک، همراه با استفاده از آن درختان برای شناسایی تاکسونهای تکتبار.
Scope
این حوزه شامل نظریه و روشهای استنتاج درختان تکاملی از دادههای صفات است: منطق کلادیستیک گروهبندی بر اساس سیناپومورفی، ساختار و خوانش درختان تبارزایی، تعیین قطبیت و ریشهیابی صفات، و ارزیابی میزان حمایت دادهها از هر شاخه. این حوزه هسته روششناختی است که تحلیل صفات را به طبقهبندی متصل میکند.
Sub-topics
Core questions
- چگونه درختان تکاملی از دادههای صفات استنتاج میشوند؟
- چه منطقی گروهبندی تاکسونها را بر اساس صفات مشتقشده مشترک توجیه میکند؟
- جهت تغییر صفت (قطبیت) چگونه تعیین میشود؟
- میزان اطمینان به یک شاخه خاص از درخت چقدر میتواند باشد؟
Key theories
- گروهبندی مبتنی بر سیناپومورفی
- اصل محوری هنینگ این است که تنها حالتهای صفت مشتقشده مشترک (سیناپومورفیها) شواهدی از نیای مشترک و در نتیجه گروههای تکتبار ارائه میدهند.
- صرفهجویی به عنوان یک معیار بهینگی
- تحلیل کلادیستیک اغلب درختی را ترجیح میدهد که کمترین تغییرات حالت صفت را نیاز دارد و هموپلازی را به عنوان هزینهای در نظر میگیرد که باید در انتخاب بین درختان رقیب به حداقل برسد.
- ارزیابی آماری درختان
- روشهای بازنمونهگیری مانند بوتاسترپ، میزان قوی بودن حمایت دادهها از کلادهای منفرد را کمیسازی میکنند و به عدم قطعیت ذاتی در تخمین درخت میپردازند.
Clinical relevance
بازسازی تبارزایی منشأ و گسترش عوامل بیماریزا را ردیابی میکند، تاریخ واگرایی دودمانها را تعیین مینماید، نزدیکترین خویشاوندان گونههای مفید یا مضر را شناسایی میکند و زیربنای پزشکی تکاملی و ژنومیک مقایسهای است.
History
رسمیسازی گروهبندی بر اساس سیناپومورفی توسط هنینگ در اواسط قرن بیستم، انقلاب کلادیستیک را آغاز کرد؛ دهههای بعدی معیارهای بهینگی صریح، جستجوی محاسباتی درخت و معیارهای پشتیبانی آماری مانند بوتاسترپ را اضافه کردند و سیستماتیک را به یک رشته کمی و تکرارپذیر تبدیل نمودند.
Debates
- صرفهجویی در مقابل استنتاج مبتنی بر مدل
- کلادیستها از لحاظ تاریخی صرفهجویی را به دلیل فرضیات کمتر ترجیح میدادند، در حالی که تبارشناسان آماری استدلال میکردند که مدلهای صریح تغییر صفت، درختان دقیقتری را به دست میدهند؛ این تنش شکلدهنده توسعه روششناختی بود.
Key figures
- Willi Hennig
- Joseph Felsenstein
- E. O. Wiley
Related topics
Seminal works
- hennig1966
- wiley2011
- felsenstein2004
- felsenstein1985
Frequently asked questions
- آیا کلادیستیک همان سیستماتیک تبارزایی است؟
- کلادیستیک هسته روش و منطق گروهبندی سیستماتیک تبارزایی است؛ این اصطلاحات اغلب به جای یکدیگر استفاده میشوند، اگرچه سیستماتیک تبارزایی طبقهبندی حاصل را نیز در بر میگیرد.
- سیناپومورفی چیست؟
- سیناپومورفی یک حالت صفت مشتقشده است که توسط دو یا چند تاکسون به اشتراک گذاشته شده است، زیرا آنها آن را از یک نیای مشترک به ارث بردهاند و شواهدی برای گروهبندی آنها با یکدیگر فراهم میکند.