تحلیل فیلوژنتیک مبتنی بر شبکه — استنتاج شبکه فیلوژنتیک

تحلیل فیلوژنتیک مبتنی بر شبکه، نمایش‌های ساختاریافته گرافی از روابط تکاملی را می‌سازد که به صراحت رویدادهای شبکه‌ای — از جمله هیبریداسیون، انتقال افقی ژن، نوترکیبی، و طبقه‌بندی ناقص تبار — را که درختان فیلوژنتیک انشعابی اکیداً نمی‌توانند نمایش دهند، در بر می‌گیرد. به جای اجبار توالی‌ها به یک درخت انشعابی واحد، این روش شکاف‌ها یا شبکه‌های موجود در داده‌ها را استنتاج کرده و آن‌ها را به صورت یک شبکه بصری می‌کند و سیگنال‌های متناقض فیلوژنتیک را که از نظر بیولوژیکی آموزنده هستند، آشکار می‌سازد.