فاصله نسلی و فاصله سریال

فاصله نسلی، بازه زمانی بین آلودگی یک مورد اولیه و آلودگی موارد ثانویه ناشی از آن است، در حالی که فاصله سریال، بازه زمانی بین شروع علائم در یک مورد اولیه و موارد ثانویه آن است. از آنجایی که زمان‌های آلودگی معمولاً مشاهده نمی‌شوند، فاصله سریال چیزی است که نظارت می‌تواند اندازه‌گیری کند و به عنوان یک جایگزین عملی برای فاصله نسلی استفاده می‌شود؛ هر دو کمیت، زمان‌بندی انتقال را به تخمین سرعت گسترش بیماری مرتبط می‌کنند.

Definition

فاصله نسلی، زمان بین آلودگی یک مورد و آلودگی افرادی است که توسط آن آلوده می‌شوند؛ فاصله سریال، زمان بین شروع علائم در یک مورد و شروع علائم در افرادی است که توسط آن آلوده می‌شوند و به عنوان یک جایگزین قابل مشاهده برای فاصله نسلی استفاده می‌شود.

Scope

این مدخل، فاصله نسلی را از فاصله سریال متمایز می‌کند، توضیح می‌دهد که هر یک چگونه با دوره‌های نهفتگی و عفونی مرتبط هستند، و چگونگی ارتباط این معیارهای زمان‌بندی نرخ رشد اپیدمی را با عدد تکثیر توصیف می‌کند. این یک موضوع مرجع روش‌شناختی است، نه راهنمایی بالینی.

Core questions

• فاصله نسلی و فاصله سریال چه تفاوتی دارند و چرا این تمایز اهمیت دارد؟
• این فواصل چگونه با دوره کمون و دوره عفونی مرتبط هستند؟
• توزیع فاصله سریال چگونه برای تخمین عدد تکثیر استفاده می‌شود؟
• چرا فاصله نسلی معمولاً تخمین زده می‌شود و مستقیماً مشاهده نمی‌شود؟

Key concepts

• فاصله نسلی (فاصله نسل)
• فاصله سریال
• دوره کمون
• دوره‌های نهفتگی و عفونی
• توزیع فاصله سریال
• نرخ رشد اپیدمی
• تخمین عدد تکثیر از زمان‌بندی

Key theories

فاصله نسلی و رابطه نرخ رشد با R

والینگا و لیپسیچ نشان دادند که شکل توزیع فاصله نسلی تعیین می‌کند که چگونه نرخ رشد اپیدمی مشاهده شده به یک عدد تکثیر تبدیل می‌شود، بنابراین معیارهای زمان‌بندی برای تفسیر قابلیت انتقال ضروری هستند.

Mechanisms

زمان‌بندی انتقال از تاریخچه طبیعی عفونت ساخته شده است: پس از آلودگی، یک دوره نهفتگی قبل از اینکه میزبان عفونی شود و یک دوره کمون قبل از ظهور علائم وجود دارد، و میزبان در طول دوره عفونی خود انتقال می‌دهد. فاصله نسلی، آلودگی به آلودگی را اندازه‌گیری می‌کند، در حالی که فاصله سریال، شروع به شروع را اندازه‌گیری می‌کند؛ این دو به طور متوسط تحت برخی مفروضات با هم منطبق هستند اما در واریانس متفاوتند. از آنجایی که زمان‌های آلودگی به ندرت مشاهده می‌شوند، تحلیلگران از توزیع فاصله سریال، همراه با نرخ رشد اپیدمی، برای تخمین عدد تکثیر استفاده می‌کنند، از جمله روش‌هایی که احتمالات «چه کسی چه کسی را آلوده کرده است» یا اعداد تکثیر متغیر با زمان را از داده‌های شروع موارد بازیابی می‌کنند.

Clinical relevance

معیارهای زمان‌بندی به تحلیلگران اجازه می‌دهد تا منحنی‌های مشاهده شده موارد را به تخمین‌های قابلیت انتقال تبدیل کنند و سرعت رشد یک شیوع را ارزیابی کنند. آنها مقادیر مرجعی هستند که فرآیند انتقال و تولید تخمین‌های اپیدمیولوژیک را توصیف می‌کنند، نه مبنایی برای تصمیمات تشخیصی یا درمانی فردی.

Epidemiology

فاصله‌های سریال و نسلی تخمین زده شده بر اساس پاتوژن متفاوت است و تحت تأثیر اقدامات کنترلی است که دوره عفونی را کوتاه می‌کند؛ بررسی‌های دوره‌های کمون برای ویروس‌های تنفسی نشان می‌دهد که چگونه زمان‌بندی تاریخچه طبیعی در بین عوامل مختلف متفاوت است، و تحلیل‌های SARS از داده‌های شروع برای تخمین قابلیت انتقال استفاده کردند. بنابراین، فواصل گزارش شده خاص پاتوژن و محیط هستند.

History

ایده فاصله بین موارد متوالی در اپیدمیولوژی دیرینه است و با توضیح فاین که فاصله سریال را از زمان‌بندی انتقال زیربنایی متمایز می‌کرد، روشن شد. در دهه ۲۰۰۰، کار والینگا و همکارانش نقش فاصله نسلی را در ارتباط نرخ رشد با اعداد تکثیر رسمی کرد و روش‌های تخمین عملی را با استفاده از داده‌های شروع توسعه داد، با چارچوب‌های نرم‌افزاری بعدی برای اعداد تکثیر متغیر با زمان.

Debates

آیا فاصله سریال می‌تواند با اطمینان جایگزین فاصله نسلی شود؟

فاصله سریال قابل مشاهده است اما می‌تواند در واریانس با فاصله نسلی متفاوت باشد و حتی زمانی که انتقال پیش‌علامتی رخ می‌دهد می‌تواند منفی باشد، بنابراین استفاده از آن به عنوان یک جایگزین ممکن است تخمین‌های عدد تکثیر را سوگیری کند مگر اینکه تفاوت در نظر گرفته شود.

Key figures

• Jacco Wallinga
• Marc Lipsitch
• Paul Fine
• Anne Cori
• Justin Lessler

Seminal works

• wallinga-lipsitch-2007
• wallinga-teunis-2004
• fine-2003

Frequently asked questions

تفاوت بین فاصله سریال و فاصله نسلی چیست؟

فاصله نسلی بین رویدادهای عفونت اندازه‌گیری می‌شود، در حالی که فاصله سریال بین زمان‌های شروع علائم اندازه‌گیری می‌شود؛ فاصله سریال قابل مشاهده است و به عنوان یک جایگزین استفاده می‌شود زیرا زمان‌های عفونت معمولاً مشخص نیستند.

چرا از این فواصل برای تخمین عدد تکثیر استفاده می‌شود؟

توزیع زمان‌بندی بین عفونت‌های متوالی، نرخ رشد اپیدمی مشاهده شده را به تعداد موارد ثانویه به ازای هر مورد مرتبط می‌کند، بنابراین برای تبدیل سرعت افزایش موارد به یک عدد تکثیر لازم است.