Recolección de Muestras y Confirmación de Laboratorio

La confirmación de laboratorio es fundamental en la investigación de un brote, ya que establece cuál es el agente causal y qué casos realmente lo presentan. El proceso comienza con la recolección de las muestras clínicas o ambientales adecuadas, en el momento oportuno, de las personas correctas, y continúa con el transporte, las pruebas y la tipificación en el laboratorio, distinguiendo finalmente los casos confirmados de aquellos que simplemente cumplen con una descripción clínica.

Definition

La recolección de muestras y la confirmación de laboratorio es la obtención, el transporte y el análisis de muestras clínicas o ambientales para identificar y caracterizar el agente causal de un brote, lo que permite la confirmación del diagnóstico, la clasificación de los casos y la vinculación de laboratorio entre los casos.

Scope

Este tema aborda por qué y cómo se obtienen las muestras durante una investigación, el papel del laboratorio en la verificación del diagnóstico y el refinamiento de la definición de caso en niveles confirmado, probable y sospechoso, y el uso de la tipificación de laboratorio y la secuenciación del genoma para vincular casos. Es conceptual y metodológico. No proporciona protocolos de manejo de muestras, umbrales de prueba o procedimientos de bioseguridad para ningún patógeno en particular, los cuales se rigen por las directrices de laboratorio y salud pública.

Core questions

• ¿Qué muestras, de quién y en qué momento de la enfermedad identificarán mejor al agente?
• ¿Cómo se recolectan, transportan y analizan las muestras para que los resultados sean válidos?
• ¿Cómo define la confirmación de laboratorio las categorías de casos confirmados, probables y sospechosos?
• ¿Cómo pueden la tipificación de laboratorio o la secuenciación del genoma vincular los casos entre sí y con una fuente?

Key concepts

• Muestras clínicas y ambientales
• Momento de la recolección en relación con la enfermedad
• Transporte de muestras y cadena de custodia
• Categorías de casos confirmados, probables y sospechosos
• Sensibilidad y especificidad de las pruebas diagnósticas
• Tipificación y subtipificación de laboratorio
• Secuenciación del genoma completo para la vinculación de casos

Mechanisms

Se recolectan muestras apropiadas, como muestras respiratorias, heces, sangre o alimentos y agua implicados, de un número suficiente de casos, idealmente antes de que el tratamiento altere el resultado, y se transportan en condiciones que preserven el agente con un manejo documentado. Luego, el laboratorio detecta e identifica el agente, y estos resultados afinan la definición de caso en niveles: un caso confirmado cumple con un criterio de laboratorio, mientras que los casos probables y sospechosos se basan en características clínicas o epidemiológicas. La subtipificación y la secuenciación del genoma completo establecen además si los casos comparten la misma cepa, lo que apoya o refuta su vínculo epidemiológico y ayuda a conectar los casos con una fuente común. El valor interpretativo de cualquier resultado depende de la sensibilidad y especificidad de la prueba.

Clinical relevance

Los médicos y el personal de laboratorio recolectan las muestras y generan los resultados que confirman el agente de un brote y clasifican sus casos, por lo que la calidad y el momento de la recolección afectan directamente la investigación. Comprender la confirmación de laboratorio ayuda a los profesionales de la salud a interpretar por qué un caso se clasifica como confirmado en lugar de sospechoso. Esta entrada describe el papel de la confirmación de laboratorio en las investigaciones y no es un protocolo de manejo de muestras, bioseguridad o diagnóstico para ningún patógeno específico.

Epidemiology

La confirmación de laboratorio fue fundamental para reconocer el SARS como una nueva enfermedad distinta en 2003, donde la caracterización clínica y de laboratorio definió el síndrome y sus casos. Más ampliamente, la integración de la secuenciación del genoma de patógenos con datos epidemiológicos se ha convertido en una forma estándar de confirmar agentes y vincular casos en investigaciones de brotes, fortaleciendo tanto la clasificación de casos como la atribución de la fuente.

History

La bacteriología a finales del siglo XIX permitió por primera vez vincular los brotes a organismos específicos identificados, y la epidemiología de campo del siglo XX incorporó la confirmación de laboratorio en las definiciones de casos escalonadas de casos confirmados, probables y sospechosos. La subtipificación molecular y, más recientemente, la secuenciación del genoma completo extendieron el papel del laboratorio de nombrar el agente a resolver qué casos están vinculados, integrando la evidencia de laboratorio y epidemiológica.

Debates

¿Cómo deben las definiciones de casos equilibrar la confirmación de laboratorio con la sensibilidad?

Exigir la confirmación de laboratorio aumenta la especificidad, pero puede pasar por alto casos reales que carecen de una prueba positiva, mientras que las definiciones clínicas amplias capturan más casos a costa de incluir no-casos; por lo tanto, las investigaciones utilizan definiciones escalonadas y las ajustan a medida que evolucionan la capacidad de prueba y las necesidades de la investigación.

Key figures

• Michael Gregg
• Yonatan Grad
• Marc Lipsitch

Seminal works

• lee-2003
• grad-lipsitch-2014

Frequently asked questions

¿Por qué se clasifican los casos como confirmados, probables o sospechosos?

Las definiciones de casos escalonadas permiten que una investigación equilibre la precisión y la exhaustividad: los casos confirmados cumplen un criterio de laboratorio y son los más específicos, mientras que las categorías probables y sospechosas capturan casos clínica o epidemiológicamente compatibles que carecen de confirmación de laboratorio, para que los casos reales no se pasen por alto al principio.

¿Cómo ayuda la secuenciación del genoma a confirmar un brote?

Más allá de nombrar el agente, la secuenciación compara los genomas de los aislados de diferentes casos; las secuencias estrechamente relacionadas apoyan la conclusión de que los casos forman parte del mismo brote y pueden compartir una fuente, complementando la evidencia epidemiológica.