Bayesian Microbiome Diversity Analysis — Probabilistische Bewertung der Community-Struktur

Die Bayessche Mikrobiom-Diversitätsanalyse wendet probabilistische Modelle an – hauptsächlich Dirichlet-Multinomial- und verwandte hierarchische Rahmenwerke – auf 16S rRNA- oder Shotgun-Metagenomik-Zähldaten an, um die Alpha-Diversität (Intra-Sample-Reichhaltigkeit und Gleichmäßigkeit) und Beta-Diversität (Kompositionsunterschiede zwischen Samples) zu schätzen, während die Unsicherheit über die gesamte Inferenzkette fortgepflanzt wird. Im Gegensatz zu frequentistischen, auf Rarifikation basierenden Ansätzen behandeln Bayessche Methoden Taxonzählungen als Ziehungen aus einer latenten Zusammensetzung, was glaubwürdige Intervalle für Diversitätsmetriken und prinzipielle Vergleiche über Gruppen mit ungleicher Sequenziertiefe ermöglicht.