Peak-kaldelse i single-cell ChIP-seq — scChIP-seq epigenomisk profilering
Peak-kaldelse i single-cell ChIP-seq er en bioinformatisk pipeline, der identificerer genomiske regioner beriget med histonmodifikationer eller transkriptionsfaktorbinding i individuelle celler. Ved at profilere kromatin-tilstande med single-cell-opløsning afslører den epigenomisk heterogenitet, der er skjult i bulk ChIP-seq-eksperimenter, hvilket gør det muligt for forskere at kortlægge regulerende landskaber på tværs af forskellige cellepopulationer inden for en kompleks vævsprøve.
Læs hele metoden
Log ind med en gratis konto for at læse dette afsnit.
Metodekort
Nabolaget af beslægtede metoder — vælg en knude for at udforske.
Kilder
- Grosselin, K., Durand, A., Marsolier, J., Poitou, A., Marangoni, E., Nemati, F., ... & Vallot, C. (2019). High-throughput single-cell ChIP-seq identifies heterogeneity of chromatin states in breast cancer. Nature Genetics, 51(6), 1060-1066. link ↗
- Ku, W. L., Nakamura, K., Gao, W., Cui, K., Hu, G., Tang, Q., ... & Zhao, K. (2019). Single-cell chromatin immunocleavage sequencing (scChIC-seq) to profile histone modification. Nature Methods, 16(4), 323-325. link ↗
Sådan citerer du denne side
ScholarGate. (2026, June 3). Single-cell Chromatin Immunoprecipitation Sequencing Peak Calling. ScholarGate. https://scholargate.app/da/bioinformatics/single-cell-chip-seq-peak-calling
Hvilken metode?
Stil denne metode ved siden af dens nærmeste slægtninge, og læs dem side om side — biblioteket lægger bøgerne på bordet; valget er dit.
- ChIP-seq Peak CallingBioinformatik↔ sammenlign
- Epigenom-dækkende associationsstudie (EWAS)Bioinformatik↔ sammenlign
- Enkeltcelle epigenom-dækkende associationsstudie (scEWAS)Bioinformatik↔ sammenlign
- Single-cell RNA-seq AnalyseBioinformatik↔ sammenlign
- Single-cell sekvensjusteringBioinformatik↔ sammenlign
Har du fundet en fejl på denne side? Indberet den eller foreslå en rettelse →