ScholarGate
Assistent
Process / pipelineBioinformatics / omics

Peak-kaldelse i single-cell ChIP-seq — scChIP-seq epigenomisk profilering

Peak-kaldelse i single-cell ChIP-seq er en bioinformatisk pipeline, der identificerer genomiske regioner beriget med histonmodifikationer eller transkriptionsfaktorbinding i individuelle celler. Ved at profilere kromatin-tilstande med single-cell-opløsning afslører den epigenomisk heterogenitet, der er skjult i bulk ChIP-seq-eksperimenter, hvilket gør det muligt for forskere at kortlægge regulerende landskaber på tværs af forskellige cellepopulationer inden for en kompleks vævsprøve.

Åbn i MethodMindSnartVideoSnartHent slides

Læs hele metoden

Kun for medlemmer

Log ind med en gratis konto for at læse dette afsnit.

Log ind

Metodekort

Nabolaget af beslægtede metoder — vælg en knude for at udforske.

Kilder

  1. Grosselin, K., Durand, A., Marsolier, J., Poitou, A., Marangoni, E., Nemati, F., ... & Vallot, C. (2019). High-throughput single-cell ChIP-seq identifies heterogeneity of chromatin states in breast cancer. Nature Genetics, 51(6), 1060-1066. link
  2. Ku, W. L., Nakamura, K., Gao, W., Cui, K., Hu, G., Tang, Q., ... & Zhao, K. (2019). Single-cell chromatin immunocleavage sequencing (scChIC-seq) to profile histone modification. Nature Methods, 16(4), 323-325. link

Sådan citerer du denne side

ScholarGate. (2026, June 3). Single-cell Chromatin Immunoprecipitation Sequencing Peak Calling. ScholarGate. https://scholargate.app/da/bioinformatics/single-cell-chip-seq-peak-calling

Hvilken metode?

Stil denne metode ved siden af dens nærmeste slægtninge, og læs dem side om side — biblioteket lægger bøgerne på bordet; valget er dit.

Sammenlign side om side
ScholarGateSingle-cell ChIP-seq peak calling (Single-cell Chromatin Immunoprecipitation Sequencing Peak Calling). Hentet 2026-06-15 fra https://scholargate.app/da/bioinformatics/single-cell-chip-seq-peak-calling · Datasæt: https://doi.org/10.5281/zenodo.20539026