Single-cell sekvensjustering — scRNA-seq Read Mapping

Single-cell sekvensjustering er det beregningsmæssige trin, der mapper millioner af korte sekvenseringsreads, produceret af single-cell RNA-seq eksperimenter, tilbage til et referencegenom eller transkriptom. I modsætning til bulk RNA-seq justering bærer hvert read en celle-barcode og en Unique Molecular Identifier (UMI), som tilsammen identificerer den oprindelige celle og det individuelle RNA-molekyle. Nøjagtig justering og barcode-demultipleksing er forudsætninger for at konstruere cell-for-gen-tællingsmatricen, der driver al downstream single-cell analyse.