Process / pipelineBioinformatics / omics

Gọi đỉnh ChIP-seq — Gọi đỉnh giải trình tự miễn dịch sắc ký

Gọi đỉnh ChIP-seq là một quy trình tính toán xác định các vùng bộ gen nơi protein quan tâm — yếu tố phiên mã hoặc sửa đổi histone — được làm giàu, dựa trên các đọc giải trình tự từ các thí nghiệm miễn dịch sắc ký chromatin. Nó chuyển đổi dữ liệu giải trình tự thô thành một tập hợp các vị trí liên kết hoặc sửa đổi có độ tin cậy cao trên toàn bộ bộ gen, cho phép phân tích hạ nguồn về điều hòa gen, trạng thái chromatin và các cơ chế biểu sinh.

Mở trong MethodMindSắp ra mắtVideoSắp ra mắtDownload slides

Đọc toàn bộ phương pháp

Chỉ dành cho thành viên

Đăng nhập bằng tài khoản miễn phí để đọc phần này.

Đăng nhập

Method map

The neighbourhood of related methods — select a node to explore.

+3 more

Nguồn tài liệu

  1. Zhang, Y., Liu, T., Meyer, C. A., Eeckhoute, J., Johnson, D. S., Bernstein, B. E., Nusbaum, C., Myers, R. M., Brown, M., Li, W., & Liu, X. S. (2008). Model-based analysis of ChIP-seq (MACS). Genome Biology, 9(9), R137. DOI: 10.1186/gb-2008-9-9-r137
  2. Landt, S. G., Marinov, G. K., Kundaje, A., Kheradpour, P., Pauli, F., Batzoglou, S., Bernstein, B. E., Bickel, P., Brown, J. B., Cayting, P., Chen, Y., DeSalvo, G., Epstein, C., Fisher-Aylor, K. I., Euskirchen, G., Gerstein, M., Gertz, J., Hartemink, A. J., Hoffman, M. M., ... Snyder, M. (2012). ChIP-seq guidelines and practices of the ENCODE and modENCODE consortia. Genome Research, 22(9), 1813–1831. DOI: 10.1101/gr.136184.111

Cách trích dẫn trang này

ScholarGate. (2026, June 3). Chromatin Immunoprecipitation Sequencing Peak Calling. ScholarGate. https://scholargate.app/vi/bioinformatics/chip-seq-peak-calling

Which method?

Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.

Compare side by side

Được tham chiếu bởi

ScholarGateChIP-seq Peak Calling (Chromatin Immunoprecipitation Sequencing Peak Calling). Truy cập ngày 2026-06-15 từ https://scholargate.app/vi/bioinformatics/chip-seq-peak-calling · Bộ dữ liệu: https://doi.org/10.5281/zenodo.20539026