Phân tích ATAC-seq
ATAC-seq (Assay for Transposase-Accessible Chromatin using sequencing) là một phương pháp để lập hồ sơ mức độ tiếp cận của chromatin trên toàn bộ bộ gen. Được phát triển bởi Buenrostro và cộng sự vào năm 2013, ATAC-seq sử dụng enzyme transposase siêu hoạt để gắn dấu các vùng chromatin mở, có thể tiếp cận, cho phép xác định nhanh chóng và nhạy các yếu tố điều hòa DNA. ATAC-seq đã trở thành một kỹ thuật tiêu chuẩn để đặc trưng hóa cảnh quan điều hòa gen, khám phá các yếu tố điều hòa đặc trưng cho từng loại tế bào và suy luận các mạng lưới điều hòa gen.
Đọc toàn bộ phương pháp
Đăng nhập bằng tài khoản miễn phí để đọc phần này.
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
Nguồn tài liệu
- Buenrostro, J. D., Giresi, P. G., Zaba, L. C., Chang, H. Y., & Greenleaf, W. J. (2013). Transposition of native chromatin for fast and sensitive epigenomic profiling of cell populations and tissues. Nature Methods, 10(12), 1213–1218. link ↗
- Corces, M. R., Buenrostro, J. D., Wu, B., Greenside, P. G., Chan, S. M., Koenig, J. L., & Greenleaf, W. J. (2017). Lineage-specific and single-cell chromatin accessibility charts human hematopoiesis. Nature Genetics, 48(10), 1193–1203. DOI: 10.1038/ng.3646 ↗
- Satpathy, A. T., Granja, J. M., Yost, K. E., Qi, Y., Meschi, F., McDermott, G. P., & Chang, H. Y. (2019). Massively parallel single-cell chromatin landscapes. Nature Biotechnology, 37(12), 1452–1462. link ↗
Cách trích dẫn trang này
ScholarGate. (2026, June 3). ATAC-seq Analysis for Chromatin Accessibility and Regulatory Landscapes. ScholarGate. https://scholargate.app/vi/genetics/atac-seq-analysis
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
- Phân tích Hi-CDi truyền học↔ compare
- Vận tốc RNA (RNA Velocity)Di truyền học↔ compare
Được tham chiếu bởi
Phát hiện lỗi trên trang này? Báo cáo hoặc đề xuất chỉnh sửa →