ไซโกไมซีทและไฟลัมเห็ดราอื่นๆ

ไซโกไมซีทเป็นการจัดกลุ่มในอดีตของเห็ดราที่เติบโตเร็ว ส่วนใหญ่เป็นเส้นใย ซึ่งตามธรรมเนียมแล้วถูกกำหนดโดยการสร้างสปอร์สืบพันธุ์แบบอาศัยเพศที่มีผนังหนาเรียกว่าไซโกสปอร์ การศึกษาทางวิวัฒนาการชาติพันธุ์ระดับโมเลกุลแสดงให้เห็นว่าไฟลัม 'Zygomycota' เดิมไม่ใช่สายวิวัฒนาการธรรมชาติเดียว และสมาชิกของมันถูกจัดสรรใหม่ให้อยู่ในไฟลัม Mucoromycota และไฟลัมที่เกี่ยวข้องหลายไฟลัม ควบคู่ไปกับส่วนอื่นๆ ของอาณาจักรเห็ดราที่แยกตัวออกมาในช่วงแรก

Definition

ไซโกไมซีทเป็นเห็ดราเส้นใยแบบโคอีโนไซติก (ส่วนใหญ่ไม่มีผนังกั้น) ซึ่งในอดีตถูกจัดกลุ่มตามการสร้างไซโกสปอร์; ปัจจุบันการจัดกลุ่มนี้ไม่ถือว่าเป็นแบบโมโนไฟเลติก สมาชิกส่วนใหญ่ถูกกระจายอยู่ใน Mucoromycota และไฟลัมที่เกี่ยวข้องซึ่งแยกตัวออกมาในช่วงแรก แทนที่จะเป็นไฟลัม Zygomycota เพียงไฟลัมเดียว

Scope

หัวข้อนี้ครอบคลุมเห็ดราไซโกไมซีทและไฟลัมอื่นๆ ที่ไม่ใช่ Dikarya ในอาณาจักรเห็ดรา โดยอธิบายไซโกสปอร์ว่าเป็นลักษณะเฉพาะที่ใช้ในการจำแนกในอดีต เหตุผลที่กลุ่มนี้ถูกแยกออกโดยการศึกษาทางวิวัฒนาการชาติพันธุ์ระดับจีโนม และตำแหน่งของสายวิวัฒนาการที่เกี่ยวข้องซึ่งแยกตัวออกมาในช่วงแรก อันดับ Mucorales ที่มีความสำคัญทางคลินิกได้รับการพิจารณาให้เป็นจุดยึด MeSH หลัก บทความนี้เป็นภาพรวมอ้างอิงและไม่ได้ให้คำแนะนำในการวินิจฉัยหรือการรักษา

Core questions

• ไซโกสปอร์คืออะไร และเหตุใดจึงเป็นตัวกำหนดไซโกไมซีทในอดีต?
• เหตุใดไฟลัม 'Zygomycota' จึงถูกยกเลิกในฐานะกลุ่มธรรมชาติ?
• ปัจจุบันอดีตไซโกไมซีทมีการกระจายอยู่ใน Mucoromycota และไฟลัมที่เกี่ยวข้องอย่างไร?
• ไฟลัมเห็ดราที่แยกตัวออกมาในช่วงแรกแตกต่างจาก Dikarya อย่างไร?

Key concepts

• ไซโกสปอร์
• เส้นใยแบบโคอีโนไซติก (ส่วนใหญ่ไม่มีผนังกั้น)
• สปอร์แรงเจียและสปอร์แรงจิโอสปอร์
• อันดับ Mucorales
• ไฟลัม Mucoromycota
• การไม่เป็นโมโนไฟเลติกของ 'Zygomycota'
• สายวิวัฒนาการเห็ดราที่แยกตัวออกมาในช่วงแรก (ฐาน)
• เส้นใยที่กว้าง คล้ายริบบิ้น ไม่มีผนังกั้นในเนื้อเยื่อ

Mechanisms

ไซโกไมซีทแบบดั้งเดิมจะสร้างไซโกสปอร์เมื่อเส้นใยที่เข้ากันได้สองเส้นหลอมรวมกัน และโดยทั่วไปจะสืบพันธุ์แบบไม่อาศัยเพศโดยสปอร์แรงจิโอสปอร์ที่ผลิตภายในสปอร์แรงเจียม; เส้นใยของพวกมันกว้างและส่วนใหญ่ไม่มีผนังกั้น (โคอีโนไซติก) การวิเคราะห์ทางวิวัฒนาการชาติพันธุ์ระดับจีโนมแสดงให้เห็นว่าอนุกรมวิธานที่มีลักษณะเหล่านี้ไม่ได้รวมกันเป็นกลุ่มเดียว ทำให้มีการจัดจำแนกใหม่ให้อยู่ในไฟลัม Mucoromycota และไฟลัมที่เกี่ยวข้องหลายไฟลัม แทนที่จะเป็นไฟลัม Zygomycota เพียงไฟลัมเดียว (Spatafora et al., 2016) ซึ่งเป็นการปรับปรุงแผนการจัดจำแนกในระดับที่สูงขึ้นของ Hibbett et al. (2007) ก่อนหน้านี้ เส้นใยที่กว้างและมีผนังกั้นน้อยของเห็ดราเหล่านี้ทำให้มีลักษณะที่โดดเด่นเมื่อมองในส่วนเนื้อเยื่อ (Guarner & Brandt, 2011)

Clinical relevance

สมาชิกของอันดับ Mucorales เป็นสาเหตุของโรค mucormycosis ซึ่งเป็นการติดเชื้อรุกรานที่ชีววิทยาของมันช่วยอธิบายว่าทำไมจึงเป็นโรคที่จัดการได้ยาก (Katragkou et al., 2014) และเส้นใยที่มีลักษณะกว้าง คล้ายริบบิ้น และมีผนังกั้นน้อยช่วยในการระบุโรคในการตรวจทางจุลพยาธิวิทยา (Guarner & Brandt, 2011) บทความนี้อธิบายการจำแนกประเภทและสัณฐานวิทยาที่ทำให้เห็ดราเหล่านี้สามารถระบุได้ และไม่ใช่แหล่งข้อมูลสำหรับคำแนะนำในการวินิจฉัยหรือการรักษาเฉพาะบุคคล

Evidence & guidelines

การจำแนกประเภทปัจจุบันของอดีตไซโกไมซีทเป็นไปตามการแก้ไขระดับไฟลัมโดยใช้จีโนมของ Spatafora et al. (2016) ซึ่งตรงข้ามกับแผนการจัดจำแนกทั้งอาณาจักรของ Hibbett et al. (2007) ก่อนหน้านี้ บริบททางคลินิกและจุลพยาธิวิทยาสำหรับ Mucorales มาจาก Guarner และ Brandt (2011) และ Katragkou et al. (2014)

History

ตลอดช่วงศตวรรษที่ 20 ไฟลัม Zygomycota ได้รวมเห็ดราที่สร้างไซโกสปอร์เข้าไว้ด้วยกัน โดยมี Mucorales เป็นอันดับที่รู้จักกันดีที่สุด เมื่อมีการสะสมข้อมูลวิวัฒนาการชาติพันธุ์ที่อิงตาม DNA กลุ่มนี้กลับกลายเป็นกลุ่มเทียมของสายวิวัฒนาการที่แตกต่างกันหลายสาย การจำแนกประเภทระดับสูงของ Hibbett et al. (2007) ได้ชี้ให้เห็นถึงความไม่เสถียรนี้แล้ว และการวิเคราะห์ระดับจีโนมของ Spatafora et al. (2016) ได้เข้ามาแทนที่ 'Zygomycota' อย่างเป็นทางการด้วย Mucoromycota และไฟลัมที่เกี่ยวข้อง

Debates

ไฟลัม 'Zygomycota' เป็นไฟลัมที่ถูกต้องหรือไม่?

การศึกษาทางวิวัฒนาการชาติพันธุ์ระดับจีโนมบ่งชี้ว่าเห็ดราที่สร้างไซโกสปอร์ไม่ได้มีบรรพบุรุษร่วมกันเพียงคนเดียว ดังนั้นไฟลัมจึงถูกยุบและสมาชิกถูกจัดสรรใหม่ให้อยู่ใน Mucoromycota และไฟลัมที่เกี่ยวข้อง; ชื่อเดิมยังคงใช้กันอย่างไม่เป็นทางการ

Key figures

• Joseph W. Spatafora
• Gerald L. Benny
• David Hibbett
• Jason E. Stajich

Seminal works

• spatafora-2016
• hibbett-2007

Frequently asked questions

ไฟลัม 'Zygomycota' ยังคงเป็นไฟลัมที่ได้รับการยอมรับหรือไม่?

ไม่ การศึกษาในระดับจีโนมแสดงให้เห็นว่าไม่ใช่สายวิวัฒนาการธรรมชาติเดียว และสมาชิกของมันถูกจัดสรรใหม่ส่วนใหญ่ให้อยู่ในไฟลัม Mucoromycota และไฟลัมที่เกี่ยวข้องหลายไฟลัมที่แยกตัวออกมาในช่วงแรก แม้ว่าคำว่า zygomycetes ยังคงใช้กันอย่างไม่เป็นทางการ

อะไรคือลักษณะเด่นของเส้นใยไซโกไมซีท?

โดยทั่วไปแล้วเส้นใยของพวกมันจะกว้างและเป็นแบบโคอีโนไซติก ซึ่งหมายความว่ามีผนังกั้น (septa) น้อยหรือไม่เลย ซึ่งทำให้มีลักษณะกว้างคล้ายริบบิ้นที่โดดเด่นเมื่อเทียบกับเส้นใยของ Dikarya ที่มีผนังกั้นอย่างสม่ำเสมอ