การศึกษาความสัมพันธ์ของลักษณะทางพันธุกรรมทั่วทั้งจีโนมที่เชื่อมโยงกับเครือข่าย (Network-based Epigenome-Wide Association Study หรือ Network EWAS)

Network EWAS เป็นการต่อยอดจากการศึกษาความสัมพันธ์ของลักษณะทางพันธุกรรมทั่วทั้งจีโนมแบบดั้งเดิม (conventional epigenome-wide association studies) โดยการนำตำแหน่งหรือบริเวณที่มีการเปลี่ยนแปลงเมทิลเลชันแตกต่างกัน (differentially methylated positions or regions) มาซ้อนทับบนเครือข่ายปฏิสัมพันธ์ทางชีวภาพ เช่น เครือข่ายปฏิสัมพันธ์ระหว่างโปรตีน (protein-protein interaction), เครือข่ายการแสดงออกร่วมกัน (co-expression), หรือเครือข่ายการควบคุมยีน (gene regulatory networks) เพื่อระบุกลุ่มโมดูลทางพันธุกรรมที่ทำงานสอดคล้องกัน (functionally coherent epigenetic modules) แทนที่จะเป็นการระบุตำแหน่ง CpG ที่แยกจากกัน การบูรณาการนี้ช่วยเพิ่มกำลังทางสถิติในการตรวจจับสัญญาณที่อ่อนแอ และเผยให้เห็นถึงการทำงานผิดปกติของระบบเมทิลเลชันที่ประสานกันตลอดทั้งวิถี (pathways).