Single-cell GWAS — Cell-Type-Specific Genetic Association Analysis
Single-cell GWAS är en integrativ bioinformatisk pipeline som kartlägger signaler från genomtäckande associationsstudier (GWAS) på landskap av enskilda cellers transkriptom för att identifiera vilka celltyper och enskilda celler som bär en oproportionerlig genetisk risk för en sjukdom eller egenskap. Genom att utnyttja atlaser för enskilda cellers RNA-sekvensering (scRNA-seq) tillsammans med sammanfattande GWAS-statistik, går metoden bortom associationsanalyser på vävnadsnivå för att avslöja de exakta cellulära sammanhang där sjukdomsassocierade genetiska varianter utövar sina effekter.
Läs hela metoden
Logga in med ett kostnadsfritt konto för att läsa avsnittet.
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
Källor
- Zhang, M. J., Hou, K., Dey, K. K., Sakaue, S., Jagadeesh, K. A., Weinand, K., ... & Price, A. L. (2022). Polygenic enrichment distinguishes disease associations of individual cells in single-cell RNA-seq data. Nature Genetics, 54(8), 1224-1234. link ↗
- Bryois, J., Calini, D., Macnair, W., Foo, L., Urich, E., Ortmann, W., ... & De Jager, P. L. (2022). Cell-type-specific cis-eQTLs in eight human brain cell types identify novel risk genes for psychiatric and neurological disorders. Nature Neuroscience, 25(8), 1104-1112. link ↗
Så citerar du den här sidan
ScholarGate. (2026, June 3). Single-Cell Genome-Wide Association Study. ScholarGate. https://scholargate.app/sv/bioinformatics/single-cell-gwas
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
- eQTL-analysBioinformatik↔ compare
- Genomtäckande associationsstudie (GWAS)Bioinformatik↔ compare
- VägberikningsanalysBioinformatik↔ compare
- RNA-seq Differential ExpressionBioinformatik↔ compare
- Single-cell eQTL-analysBioinformatik↔ compare
- Analys av enkelcells-RNA-sekvenseringBioinformatik↔ compare
Refereras av
Hittade du ett fel på sidan? Rapportera eller föreslå en rättelse →