Analys av kopienummer-variationer i encellig nivå
Analys av encellig kopienummer-variation (scCNV) detekterar vinster och förluster av genomiska segment inom enskilda celler, vilket gör det möjligt för forskare att lösa intratumoral heterogenitet, rekonstruera klonal evolution och skilja maligna från normala celler med encellig upplösning. Metoden kan tillämpas direkt på encelligt helgenomsekvenseringsdata eller härledas från läsdjup-signaler i scRNA-seq- eller scATAC-seq-experiment.
Läs hela metoden
Logga in med ett kostnadsfritt konto för att läsa avsnittet.
Metodkarta
Närområdet av besläktade metoder — välj en nod för att utforska.
Källor
- Garvin, T., Aboukhalil, R., Kendall, J., Baslan, T., Atwal, G. S., Hicks, J., Wigler, M., & Schatz, M. C. (2015). Interactive analysis and assessment of single-cell copy-number variations. Nature Methods, 12(11), 1058–1060. link ↗
- Gao, R., Bai, S., Henderson, Y. C., Lin, Y., Schalck, A., Yan, Y., Kumar, T., Hu, M., Sei, E., Davis, A., Wang, F., Shaitelman, S. F., Wang, J. R., Chen, K., Moulder, S., Lai, S. Y., & Navin, N. E. (2021). Delineating copy number and clonal substructure in human tumors from single-cell transcriptomes. Nature Biotechnology, 39(5), 599–608. link ↗
Så citerar du den här sidan
ScholarGate. (2026, June 3). Single-cell Copy Number Variation Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/sv/bioinformatics/single-cell-copy-number-variation-analysis
Vilken metod?
Placera den här metoden bredvid sina närmaste släktingar och läs dem sida vid sida — biblioteket lägger fram böckerna på bordet; valet är ditt.
- Analys av kopienummervariationer – detektion och tolkning av CNVBioinformatik↔ jämför
- Single-cell epigenome-wide association study (scEWAS)Bioinformatik↔ jämför
- Single-cell GWASBioinformatik↔ jämför
- Analys av enkelcells-RNA-sekvenseringBioinformatik↔ jämför
- Analys av differentiell genexpression i enkelcells-RNA-sekvenseringBioinformatik↔ jämför
- Variant CallingBioinformatik↔ jämför
Refereras av
Hittade du ett fel på sidan? Rapportera eller föreslå en rättelse →