Микробные сообщества и биопленки
В природе микробы редко существуют поодиночке; они образуют структурированные сообщества и биопленки, прикрепленные к поверхностям, чьи коллективные свойства заметно отличаются от свойств отдельных свободноживущих клеток.
Definition
Микробные сообщества — это совокупности взаимодействующих микроорганизмов, разделяющих общую среду, а биопленки — это структурированные сообщества клеток, прикрепленных к поверхности и погруженных в самопроизведенный внеклеточный матрикс.
Scope
Эта тема охватывает взаимодействия, которые структурируют микробные сообщества, включая конкуренцию, кооперацию и метаболический обмен; формирование, архитектуру и жизненный цикл биопленок; внеклеточный матрикс и измененную физиологию клеток биопленок; кворумное чутье и скоординированное поведение; а также экологические и практические последствия жизни в сообществах и на поверхностях.
Core questions
- Как взаимодействия между микробами структурируют сообщества?
- Как формируются и развиваются биопленки?
- Почему клетки биопленки ведут себя иначе, чем свободноживущие клетки?
- Как микробы координируют групповое поведение?
Key concepts
- Взаимодействия в сообществе и метаболический обмен
- Формирование и архитектура биопленок
- Внеклеточный полимерный матрикс
- Кворумное чутье
- Измененная физиология клеток биопленки
Key theories
- Биопленочный режим роста
- Костертон и коллеги утверждали, что прикрепленные к поверхности, заключенные в матрикс биопленки являются преобладающим и отличным способом микробной жизни, при котором клетки демонстрируют измененную физиологию и повышенную толерантность по сравнению со свободноживущими клетками.
Mechanisms
Микробы в сообществах взаимодействуют посредством конкуренции за ресурсы, кооперативного обмена метаболитами и химической сигнализации. Формирование биопленки начинается с прикрепления к поверхности, за которым следуют рост, производство внеклеточного матрикса, который удерживает клетки вместе, и созревание в структурированное сообщество; клетки внутри биопленок часто демонстрируют измененную экспрессию генов и большую толерантность к стрессам. Скоординированное поведение, такое как кворумное чутье, позволяет популяциям коллективно реагировать на свою плотность.
Clinical relevance
Биопленки образуются на природных поверхностях, в промышленных системах и на медицинских устройствах, где их толерантность к антимикробным препаратам и защитным механизмам хозяина способствует стойкому загрязнению и хроническим инфекциям, что делает биологию сообществ и биопленок важной в экологическом, промышленном и медицинском контекстах.
History
Признание того, что большинство микробов в природных и клинических условиях живут в прикрепленных к поверхности биопленках, а не в виде свободно плавающих клеток, росло на протяжении конца двадцатого века, при этом обзоры, такие как обзор Костертона и коллег в 1999 году, подчеркивали биопленки как общую причину стойких инфекций и особый способ микробной жизни.
Key figures
- J. William Costerton
- E. Peter Greenberg
Related topics
Seminal works
- costerton1999
- madigan2018
Frequently asked questions
- Почему биопленки труднее уничтожить, чем свободно плавающие бактерии?
- Клетки в биопленке защищены внеклеточным матриксом и часто демонстрируют измененную физиологию, что в совокупности повышает их толерантность к антимикробным агентам и защитным механизмам хозяина по сравнению с теми же клетками, растущими свободно. Именно поэтому биопленки связаны со стойким загрязнением и инфекциями.
Methods for this concept
- Metagenomic Binning
- Multi-omics microbiome diversity analysis
- Network-based microbiome diversity analysis
- Time-series microbiome diversity analysis
- Single-cell Microbiome Diversity Analysis
- Minimum Inhibitory Concentration Assay
- Antimicrobial Susceptibility Testing in Veterinary Medicine
- Bayesian Microbiome Diversity Analysis